مطالعه بیوانفورماتیکی و زیر همسانه سازی یک نوع اندولیزین
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: بیست و یکمین کنگره ملی و نهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران
- کد COI اختصاصی: BIOCONF21_0331
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 594
نویسندگان
گروه زیست فناوری، دانشکده زیست فناوری، دانشگاه سمنان، سمنان، ایران
گروه زیست فناوری، دانشکده زیست فناوری، دانشگاه سمنان، سمنان، ایران
گروه زیست شناسی، دانشکده زیست سناسی، دانشگاه سمنان، سمنان
چکیده
شناسایی ترکیبات و مولکولهای ضد باکتریایی جدید، بعنوان جایگزین برای رفع نیازهای پزشکی در درمان عفونت مقاوم به آنتی-بیوتیک، مورد توجه است. از جمله این مولکولها، لیزینها هستند.. N استیل مورامیل - L آلانین آمیدازها که با نام اندولایزین نیز شناخته می شوند، آنزیمهایی هستند که در ژنوم فاژ رمزگذاری شده، و توانایی شکستن پیوند آمید در دیواره پپتیدوگلیکان باکتریایی را دارند. خواص فیزیکوشیمیایی و ساختار ثانویه و فضایی این آنزیم با کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیک، مطالعه و در نهایت کیفیت ساختارهای سوم پیشگویی شده به وسیله نرم افزار q-mean با در صد اطمینان ۰/۶ بررسی گردید. درادامه ژن ساخته شده کدکننده N استیل مورامیل - Lآلانین آمیداز فاژ SPP۱ ، در ناقل pET ۲۸a زیر همسانه سازی شد.بعد از تایید همسانه با استفاده از هضم آنزیمی، پروتئین نوترکیب با کمک ۱۰۰mM IPTG القا شد. پروتئین نوترکیب با کمک ستون نیکل با استفاده از شیب ایمیدازول mM ۱۰۰تخلیص گردید. پس از اطمینان از حضور پروتئین برای حذف نمکها و ایمیدازول، آنزیم نوترکیب در بافر PBS دیالیز شد. مطالعات بیوانفورماتیکی مشخص کرد که این پروتئین دارای پی اچ ایزوالکتریک ۹/۶ ، وزن مولکول ۳۰ کیلو دالتون، شاخص آلفاتیک ۸۳/۸۷ و شاخص قطبیت -۰/۴۹ است. ساختار ثانویه این پروتئین شامل % ۳۴/۳۲ مارپیچ آلفا، %۶/۶۴ مربوط به صفحه های بتا، %۲۳ مربوط به رشته های امتداد یافته و % ۳۵ مربوط به مارپیچ های تصادفی است. بعد از مشاهده باند ۳۳ کیلودالتونی در الکترفورز SDS-PAGE ۱۲%، واکنش آنزیمی با آنزیم مورد نظر جهت بررسی رفتار آنزیمی برای اثر ضد باکتریایی اشریشیاکلای و استافیلوکوکوس اورئوس در حال انجام است.کلیدواژه ها
اندولایزین، فاژSPP۱ ، N استیل مورامیل L آلانین آمیداز، سازه نوترکیبمقالات مرتبط جدید
- بررسی خاصیت ضدبیوفیلمی ترکیب گیاهی ۱و۸-سینئول علیه آسینتوباکتر بومانی دارای مقاومت داروئی
- ابر دریاچه باستانی ری - مقدمه ای بر تغییرات سطح-حجم آب در طول زمان از دیدگاه مورفولوژی
- تاثیرنشانگ رهای غیرتهاجمی بزاق در تشخیص سرطان دهان
- بررسی میزان فراوانی بیماری فاویسم در کودکان زیر۶ سال در شهر بوشهر
- بررسی تاثیرپاالیندگی گیاه Salsola crassa بر کاهش آلودگیفاضلاب صنعتی
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.