مطالعه وجود SNPها در ژن های SUNو OVATEدخیل در شکل میوه گوجه فرنگی
محل انتشار: مجله علوم باغبانی، دوره: 35، شماره: 2
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 222
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JHSUM-35-2_001
تاریخ نمایه سازی: 24 خرداد 1400
چکیده مقاله:
شکل میوه از صفات بسیار مهم و موثر در کیفیت گوجهفرنگی (Solanum lycopersicum L.) بوده و ژنهای SUNو OVATE از ژنهای کلیدی کنترل کننده طول میوه میباشند. به منظور شناسایی SNPها (Single nucleotide polymorphism) در این ژنها، قطعاتی از نواحی کد کننده آنها در ۹۶ ژنوتیپ گوجهفرنگی تکثیر و با آنزیمهای محدود کننده TruI وPstI هضم شد. هضم قطعات تکثیری این دو ژن در ژنوتیپها چندشکلی تولید نکرد بنابراین چهار ژنوتیپ از جمعیتهای مختلف انتخاب و قطعه تکثیری ژنها در این ژنوتیپها توالییابی شد. همردیفی توالیها برای شناسایی SNPها با استفاده از نرم افزار Clustal Omega انجام گرفت. توالییابی قطعه تکثیری ژن SUN منجر به شناسایی یک ناحیه اینترونی به طول ۳۶۹ جفت باز شد. بر اساس نتایج، در ژن SUN ده SNP شناسایی شد. از کل SNPهای شناسایی شده در این ژن، ۸۰ درصد آنها از نوع همجنس و ۲۰ درصد آنها از نوع غیرهمجنس بود. در ژن OVATE پنج SNP شناسایی شد که ۸۰ درصد آنها از نوع همجنس و ۲۰ درصد آنها از نوع غیرهمجنس بود. میانگین تعداد SNPها به ازای هر ۱۰۰ جفت باز در نواحی اگزونی و اینترونی ژن SUN به ترتیب ۹/۰ و ۶۲/۱ بود. در ژن OVATE به ازای هر ۱۰۰ جفت باز نیمSNP در ناحیه اگزونی شناسایی شد. با توجه به نقش مهم کیفیت میوه بخصوص شکل آن در بازارپسندی گوجهفرنگی، SNPهای شناسایی شده در این تحقیق میتواند در برنامههای اصلاحی گوجه فرنگی برای مطالعه تنوع ژنتیکی، تهیه نقشههای ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای عملکردی مرتبط با شکل میوه مورد استفاده قرار گیرد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
ساناز خضرلو
گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشگاه ارومیه
بابک عبدالهی مندولکانی
گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشگاه ارومیه
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :