بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 279

فایل این مقاله در 19 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPB-9-2_006

تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

کلسیم، یک جزء حیاتی مهم برای شماری از مسیر های انتقال پیام در گیاهان است که به واسطه انواعی از گیرنده های اختصاصی از جمله پروتئین های شبه کلسی نورین B (CBL) در درک تنش های محیطی، عمل می کند. در پژوهش حاضر، با رویکردهای بیوانفورماتیک، ۱۱ ژن رمزکننده پروتئین های شبه کلسی نورین B با درجه حفاظت شدگی زیاد در گیاه گوجه فرنگی شناسایی و تایید شد. با بهره گیری از یک روش مبتنی بر ارتوژنی، این پروتئین ها به ۵ کلاس مجزای SlCBL۱، SlCBL۳، SlCBL۴، SlCBL۸ و SlCBL۱۰ تقسیم بندی و نام گذاری شدند. تحلیل توالی های پروتئینی نشان داد که همه اعضای CBLهای ۱ و ۴ که شامل ۵ پروتئین می شوند، یک ناحیه حفاظت شده مریستویلاسیون در بخش N-ترمینال دارند. بررسی با روش PCR نیمه کمی نشان داد که میان CBLهای کلاس ۱، بیان ژن SlCBL۱-۳ در هردو تنش خشکی، حمله ویروس و ترکیب این دو، تنها در رقم حساس افزایش داشته است. درباره CBLهای کلاس ۳، اگرچه دو ژن SlCBL۳-۱ و SlCBL۳-۲ در تنش خشکی در هردو رقم حساس و مقاوم، افزایش بیان نشان دادند، اعمال هم زمان دو تنش، اثر افزایشی بر بیان این ژن ها نداشت. بین دو همولوگ کلاس ۴ نیز، تنها SlCBL۴-۱ در هردو تنش خشکی و ویروس افزایش بیان نشان داد. براساس نتایج، رفتار بیانی ژن های کلاسSlCBL۸ در شرایط مختلف تنش و ارقام مختلف، متنوع بود. بیان تنها ژن موجود در کلاس SlCBL۱۰ نیز در رقم حساس با هیچ کدام از تنش های یاد شده افزایش نیافت و تنها در رقم مقاوم، در تنش خشکی افزایش بیان داشت. به طورکلی، استنباط شد که با تغییر الگوی بیان ژن های CBL در هردو تنش زیستی و غیرزیستی، احتمالا مسیر های پیام رسانی CBL/CIPK متفاوتی در گیاهان حساس و مقاوم فعال می شوند.

کلیدواژه ها:

بیان ژن ، پروتئین های شبه کلسی نورین B ، تنش خشکی ، حمله ویروس ، کلسیم ، گوجه فرنگی

نویسندگان

پیمان آقائی

گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران

محمدعلی ابراهیمی

گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

سید علی حسینی تفرشی

گروه سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، صندوق پستی ۵۳۱۵۳-۸۷۳۱۷ کاشان، ایران

مریم حائری نسب

گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران

شکوفه انتشاری

گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Albrecht, V., Weinl, S., Blazevic, D., D'Angelo, C., Batistic, O., ...
  • Aravind, L., Mazumder, R., Vasudevan, S. and Koonin, E. V. ...
  • Batistic, O., Kim, K. N., Kleist, T., Kudla, J. and ...
  • Batistic, O. and Kudla, J. (۲۰۰۴) Integration and channeling of ...
  • Batistic, O. and Kudla, J. (۲۰۰۹) Plant calcineurin B-like proteins ...
  • Cheong, Y. H., Kim, K. N., Pandey, G. K., Gupta, ...
  • D'angelo, C., Weinl, S., Batistic, O., Pandey, G. K., Cheong, ...
  • Drerup, M. M., Schlücking, K., Hashimoto, K., Manishankar, P., Steinhorst, ...
  • Gu, Z., Ma, B., Jiang, Y., Chen, Z., Su, X. ...
  • Hamel, L. P., Nicole, M. C., Sritubtim, S., Morency, M. ...
  • Ho, C. H., Lin, S. H., Hu, H. C. and ...
  • Kim, B. G., Waadt, R., Cheong, Y. H., Pandey, G. ...
  • Kim, K. N., Cheong, Y. H., Gupta, R. and Luan, ...
  • Kleist, T. J., Spencley, A. L. and Luan, S. (۲۰۱۴) ...
  • Kolukisaoglu, Ü., Weinl, S., Blazevic, D., Batistic, O. and Kudla, ...
  • Kudla, J., Xu, Q., Harter, K., Gruissem, W. and Luan, ...
  • Luan, S. (۲۰۰۹) The CBL–CIPK network in plant calcium signaling. ...
  • Luan, S., Kudla, J., Rodriguez-Concepcion, M., Yalovsky, S. and Gruissem, ...
  • Mahajan, S., Sopory, S. K. and Tuteja, N. (۲۰۰۶) Cloning ...
  • Mao, J., Manik, S., Shi, S., Chao, J., Jin, Y., ...
  • Mohanta, T. K., Malnoy, M., Mohanta, N. and Kanchiswamy, C. ...
  • Mohanta, T. K. and Mohanta, N. (۲۰۱۳) Genome wide identification ...
  • Mohanta, T. K., Mohanta, N., Mohanta, Y. K., Parida, P. ...
  • Monihan, S. (۲۰۱۱) The Arabidopsis Calcineurin B-Like۱۰ calcium sensor couples ...
  • Pandey, G. K., Cheong, Y. H., Kim, K. N., Grant, ...
  • Pandey, G. K., Kanwar, P., Singh, A., Steinhorst, L., Pandey, ...
  • Qiu, Q. S., Guo, Y., Dietrich, M. A., Schumaker, K. ...
  • Quan, R., Lin, H., Mendoza, I., Zhang, Y., Cao, W., ...
  • Reddy, A. S., Ali, G. S., Celesnik, H. and Day, ...
  • Rudd, J. J. and Franklin‐Tong, V. E. (۲۰۰۱) Unravelling response‐specificity ...
  • Schlicker, A., Domingues, F. S., Rahnenführer, J. and Lengauer, T. ...
  • Shao, H., Chu, L., Jaleel, C. A. and Zhao, C. ...
  • Tang, R. J., Liu, H., Yang, Y., Yang, L., Gao, ...
  • Tang, R. J., Zhao, F. G., Garcia, V. J., Kleist, ...
  • Velásquez, A. C., Chakravarthy, S. and Martin, G. B. (۲۰۰۹) ...
  • Wang, M., Gu, D., Liu, T., Wang, Z., Guo, X., ...
  • Xu, J., Li, H. D., Chen, L. Q., Wang, Y., ...
  • Zhang, H., Yin, W. and Xia, X. (۲۰۰۸) Calcineurin B-Like ...
  • Zhu, J. K. (۲۰۰۲) Salt and drought stress signal transduction ...
  • Zhu, J. K. (۲۰۱۶) Abiotic stress signaling and responses in ...
  • نمایش کامل مراجع