گزارش گونه‏ های نوکاردیای جدا‏سازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، اصفهان، ایران

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 395

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_BJM-4-16_005

تاریخ نمایه سازی: 12 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست‏های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری‏های ساکن خاک را شامل می‏شوند، که در جهان پخش شده‏اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون‏های تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزوله‏های نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ‏‏ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روش‏ها، سویه استاندارد DSM ۴۳۷۵۷ Nocardia asteroides استفاده شد. در ادامه، روش PCR با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام شد. نتایج: با تحلیل اطلاعات فنوتیپی و مولکولی، به‏ویژه تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، ژن‏های نوکاردیای‏های جداسازی شده از خاک اصفهان، که در ادامه به آن‏ها اشاره شده است، درپایگاه داده NCBI باAccession number مربوط به هر ژن ثبت شدند. نوکاردیاهای ثبت شده در NCBI: Nocardia cyriacigeorgica KC۵۷۷۱۵۱, Nocardia asteroides KC۵۷۷۱۵۲, Nocardia cummidelens KC۵۷۷۱۵۳, Nocardia asteroides KC۵۷۷۱۵۵, Nocardia asteroides KC۵۷۷۱۵۵, Nocardia coubleae KC۵۷۷۱۵۶ .. بحث و نتیجه ‏گیری: در این پژوهش ۶ گونه نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد، که برخی از این گونه‏های جداسازی شده از خاک ایران، اصفهان، در زمان جداسازی و تشخیص،گونه‏های جدیدی بودند. برای تشخیص بیشترگونه‏های مختلف نوکاردیا می‏توان در مطالعات بعدی از تکثیر و تعیین توالی ژن‏های دیگر این باکتری از جمله ITS,hsp۶۵ secA, rpoB  و sod بهره گرفت. 

کلیدواژه ها:

گونه‏ های جدید نوکاردیا ، توالی‏ یابی ۱۶SrRNA ، نمونه ‏های خاک ، اصفهان ، ایران

نویسندگان

سمانه بوربور

دانشجوی دکترای تخصصی میکروبشناسی، دانشگاهعلوم پزشکی اصفهان، ایران

جمشید فقری

دانشیار میکروبشناسی، دانشگاهعلوم پزشکی اصفهان، ایران

شراره مقیم

دانشیار میکروبشناسی، دانشگاهعلوم پزشکی اصفهان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • (1) Kämpfer P., Huber B., Buczolits S., Thummes K., Grün-Wollny ...
  • (2) Kachuei R., Mirnejad R., Emami M., Khoobdel M. Diversity ...
  • (3) Zakaria A., Elwatidy S., Elgamal E. Nocardia brain abscess: ...
  • (4) Brown- Elliott BA., Brown JM., Conville PS., Wallace RJ. ...
  • (5) Laurent Fj PFBP. Rapid identification of clinically relevant Nocardia ...
  • (6) Rodríguez-Nava V., Couble A., Devulder G., Flandrois JP., Boiron ...
  • (7) Zhang J., Liu Z., Goodfellow M. Nocardia caishijiensis sp. ...
  • (8) Pei AY., Oberdorf WE., Nossa CW., Agarwal A., Chokshi ...
  • (10) Baker GC., Smith JJ., Cowan DA. Review and re-analysis ...
  • (11) Chakravorty S., Helb D., Burday M., Connell N., Alland ...
  • (12) Khan ZU., Neil L., Chandy R., Chugh TD., Al-Sayer ...
  • (13) Faghri J., Bourbour S., Moghim S., Meidani M., Safaei ...
  • (14) Rodríguez-Nava V., Khan Z., Pötter G., Kroppenstedt RM., Boiron ...
  • (15) Ayyar S., Tendolkar U., Deodhar L. A comparison of ...
  • (16) Lamm AS., Khare A., Conville P., Lau PC., Bergeron ...
  • (17) Naidoo D., Kumari S., Bux F. Characterization of Nocardia ...
  • (18) Reddy A., Garg P., Kaur I. Spectrum and clinicomicrobiological ...
  • (19) Winn WC., Allen SD., Janda WM., Koneman EW., Schreckenberger ...
  • (20) Saitou N. The neighbor-joining method a new method for ...
  • (21) Jukes TH., Cantor CR. CHAPTER 24- Evolution of Protein ...
  • (22) Nikou MM., Ramezani M., Seyedmahdi SS. Polyphasic identification of ...
  • (24) Saubolle MA., Sussland D. MINIREVIEW - Nocardiosis: Review of ...
  • (26) Shojaei H., Hashemi A., Heidarieh P., Eshraghi S., Khosravi ...
  • (27) Maldonado L., Hookey JV., Ward AC., Goodfellow M. The ...
  • (28) Golinska P., Wang D., Goodfellow M. Nocardia aciditolerans sp. ...
  • نمایش کامل مراجع