ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی miRNAها و ایزومیرهای جدید در بافت کبد گاوهای شیری

محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 47، شماره: 4
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 356

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1015816

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-47-4_009

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

چکیده مقاله:

تعادل منفی انرژی (NEB) در گاوهای شیری پرتولید در چند هفته نخست پس از زایمان رخ می­دهد و به دلیل اثرگذاری منفی بر باروری و سلامتی اهمیت اقتصادی زیادی در گله­های گاو شیری دارد. بنابراین، شناسایی هر چه بهتر سازوکارهای تنظیمی موثر در این اختلال سوخت وسازی (متابولیکی) اهمیت دارد. یکی از عامل های تنظیمی موثر در NEB، miRNAها هستند. به رغم اهمیت NEB، سازوکارهای تنظیمی مربوط به miRNAها در این دوره به خوبی شناخته نشده­اند. در این بررسی داده­های miRNA-seq مربوط به بافت کبد هشت گاو شیری هلشتاین موجود در بخش GEO بانک اطلاعاتی NCBI برای شناسایی miRNAها و ایزومیرهای جدید تجزیه وتحلیل شدند. در مجموع، 291 miRNA جدید که ژن همتا (همولوگ) در دیگر گونه­ها داشتند، و 164 miRNA جدید بدون همتا شناسایی شد. بررسی عملکرد ژن­های هدف miRNAهای شناسایی شده نشان داد، این ژن­ها در مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) مرتبط با NEB نقش دارند. افزون بر این 446 ایزومیر و 95 miRNA* جدید برای نخستین بار در ژنگان (ژنوم) گاو گزارش شد. یافته های به دست آمده از این بررسی اطلاعات جدیدی برای درک بهتر نقش تنظیمی miRNAها در NEB فراهم می­کند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

زهره مزدوری

دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه علوم دام و طیور، پردیس ابوریحان دانشگاه تهران

محمدرضا بختیاری زاده

استادیار، گروه علوم دام و طیور، پردیس ابوریحان دانشگاه تهران

عبدالرضا صالحی

دانشیار، گروه علوم دام و طیور، پردیس ابوریحان دانشگاه تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bartel, D. P. (2004). MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell, 116, ...
  • Barturen, G., Rueda, A., Hamberg, M., Alganza, A., Lebron, R., ...
  • Bolger, A. M., Lohse, M. & Usadel, B. (2014). Trimmomatic: ...
  • Bortoluzzi, S., Bisognin, A., Biasiolo, M., Guglielmelli, P.,  Biamonte, F., ...
  • Bu, P., Wang, L., Chen, K. Y., Rakhilin, N., Sun, ...
  • Clemens, J. C., Worby, C. A., Simonson-Leff, N., Muda, M., ...
  • Denman, R. (1993). Using RNAFOLD to predict the activity of ...
  • Diskin, M. & Morris, D. (2008). Embryonic and early foetal ...
  • Fatima, A., Analysis of hepatic microRNA expression in postpartum dairy ...
  • Fatima, A. & Morris, D. G. (2013). MicroRNAs in domestic ...
  • Fatima, A., Waters,  S., O’Boyle, P., Seoighe, C. & Morris, ...
  • Fatima, A., Lynn, D.  J., O’Boyle, P., Seoighe, C. & ...
  • Fenwick, M. A., Fitzpatrick, R., Kenny, D. A., Diskin, M. ...
  • Ferland-McCollough, D., Ozanne, S., Siddle, K., Willis, A. & Bushell, ...
  • Fernandez-Valverde, S. L., Taft, R. J. & Mattick, J. S. ...
  • Friedländer, M. R., Mackowiak, S. D., Li, N., Chen, W. ...
  • Friedman, R. C., Farh, K. K. H., Burge, C. B. ...
  • Go, G. W. & Mani, A. (2012). Low-density lipoprotein receptor ...
  • IUM, T. (2012). ENCODE project writes eulogy for junk DNA. SCIENCE, 337, ...
  • Jin, W., Grant, J. R., Stothard, P., Moore, S. S. ...
  • John, B., Enright, A. J., Aravin, A., Tuschl, T., Sander, ...
  • Jopling, C. (2012). Liver-specific microRNA-122: Biogenesis and function. RNA biology, 9, 137-142. ...
  • Katoh, T., Sakaguchi, Y., Miyauchi, K., Suzuki, T., Kashiwabara, S.i., ...
  • Kaur, K., Pandey, A. K,. Srivastava, S., Srivastava, A. K. ...
  • Kertesz, M., Iovino, N., Unnerstall,  U., Gaul, U. &  Segal, ...
  • Langmead, B. (2010).  Aligning short sequencing reads with Bowtie. Current Protocols ...
  • Lawless, N., Foroushani, A. B., McCabe, M. S., O’Farrelly, C. ...
  • Li, J. Y., Yong, T. Y., Michael, M. Z. &  ...
  • Li, M., Yang, Y., He, Z. X.,  Zhou, Z. W., ...
  • Li, N., You, X., Chen, T., Mackowiak, S. D., Friedländer, ...
  • Li, R., Zhang, C. L., Liao, X. X., Chen, D., ...
  • Loor, J. J., Everts, R. E., Bionaz, M., Dann, H. ...
  • Lucy, M. (2006). Fertility in high-producing dairy cows: reasons for ...
  • McCabe, M., Waters, S., Morris, D., Kenny, D., Lynn, D. ...
  • McCarthy, S. D., Waters, S. M., Kenny, D. A., Diskin, ...
  • Mehta, J. P. (2014). Sequencing Small RNA: Introduction and Data ...
  • Nielsen, M., Hansen, J., Hedegaard, J., Nielsen, R., Panitz, F., ...
  • Papa, S., Zazzeroni, F., Fu, Y. X., Bubici, C., Alvarez, ...
  • Peng, Z., Cheng, Y., Tan, B.C.M., Kang, L., Tian, Z., ...
  • Phillips, T. (2008). Regulation of transcription and gene expression in ...
  • Pogribny, I. P., Starlard-Davenport,  A., Tryndyak, V. P., Han, T., ...
  • Schmieder, R. & Edwards, R. (2011). Quality control and preprocessing ...
  • Sheldon, I. M. (2004). The postpartum uterus. Veterinary Clinics of North ...
  • Sturm, M., Hackenberg, M., Langenberger, D. & Frishman, D. (2010). ...
  • Tabas-Madrid, D., Muniategui, A., Sánchez-Caballero, I., Martínez-Herrera, D. J., Sorzano, ...
  • Timoneda, O., Balcells, I., Núñez, J. I., Egea, R., Vera, ...
  • Wang, K., Zhang, S., Marzolf, B., Troisch, P., Brightman, A., ...
  • Wang, L., Jia, X. J., Jiang, H.J,. Du, Y., Yang, ...
  • Wathes, D. C., Cheng, Z., Chowdhury, W., Fenwick, M. A., ...
  • Xia, K., Zhang, Y., Cao, S., Wu, Y., Guo, W., ...
  • Xu, G., Gao, Z., He, W., Ma, Y., Feng, X., ...
    • نمایش کامل مراجع