The interaction of L-Cys with α-Chymotrypsin: Molecular Dynamic simulation and spectroscopic methods
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: پانزدهمین همایش بیوشیمی فیزیک ایران
- کد COI اختصاصی: CBC15_061
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 347
نویسندگان
Department of Biology, Faculty of Science, Shahrekord University, Shahrekord, P. O. Box.۱۱۵, Iran
Department of Biology, Faculty of Science, Shahrekord University, Shahrekord, P. O. Box.۱۱۵, Iran
Department of Biology, Faculty of Science, Shahrekord University, Shahrekord, P. O. Box.۱۱۵, Iran
چکیده
L-Cysteine (L-Cys) is one of 20 α-amino acids, which connected by peptide and disulfide bonds in proteins and polypeptides. The L-Cys plays a very considerable role in stabilization of protein structure at a higher level due to disulfide bridges. The interaction of small chemical molecules, such as drugs to proteins has been very much considered in recent years. Distinguishing the thermodynamic and kinetic properties of α-Chymotrypsin (α-Chy) helps us for understanding this protein. For investigating the effect of L-Cys on structure and activity of α-Chy, spectroscopic and computational approaches were used. The UV–Vis results are revealed that the most absorption peaks were found at 260–300 nm due to Trp residues. Hyperchromism shift was seen in the presence of L-Cys. This was because of the forming of the ground state complex between α-Chy and L-Cys. Static quenching was seen by emission intensity changes. The more polar environment for Trp residue was recommended by the fluorescence quenching. The secondary structure alterations were slight. A reduce in the content of β-sheet structure and an increase in the a-helix were shown. Kinetic parameters display that L-Cys inhibited the activity of the enzyme by a mixed mod. Molecular docking results show a negative value for the Gibbs free energy of the binding of L-Cys to α-Chy with hydrophobic interactions. The molecular dynamic simulation revealed α-Chy becomes more stable in the presence of L-Cys.کلیدواژه ها
L-Cysteine, α-Chymotrypsin, Circular dichroism, Fluorescence quenching, Molecular dynamic simulationمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.