An Alpha Synuclein- Peptide Docking Study to Select Appropriate Peptides Interacting with the Protein NAC Domain
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: پانزدهمین همایش بیوشیمی فیزیک ایران
- کد COI اختصاصی: CBC15_032
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 488
نویسندگان
Institute of Biochemistry & Biophysics (IBB), University of Tehran, Tehran, Iran
Institute of Biochemistry & Biophysics (IBB), University of Tehran, Tehran, Iran
Institute of Biochemistry & Biophysics (IBB), University of Tehran, Tehran, Iran
Department of Biological Sciences, Institute for Advanced Studies in Basic Sciences (IASBS), Zanjan, Iran
چکیده
α-synuclein (AS) is one of the presynaptic intrinsically disordered proteins. However, the change in environmental factors (such as pH, ionic strength, severe shaking) induces the formation of AS aggregations and amyloid fibrils in vitro. Lewy bodies are aggregates that are seen in Parkinson s patients. The main component of the Lewy bodies are the amyloid fibers of AS. The exact function of this protein and the mechanisms that cause toxicity and cell death are still not well defined. Inhibition AS aggregations may be an approach to preventing and treating Parkinson s disease. A number of polyphenol antioxidants have been discovered that inhibit AS fibers. However, their effects are non-specific. Generally, protein-protein interactions are highly specific and well-regulated. In this study, we attempted to design using computational methods and synthesize a new peptide according to AS sequence 68-83, and its inhibitory effects on AS accumulations will be examined. Approximately 78 modified linear peptides were designed in sequences AS (68-83). The circular forms of these peptides (N to C terminal cyclization) were also considered. The protein-peptide docking with the HADDOCK web server performed on these linear and circular peptides and their binding energy and interaction with the protein were determined. Based on HADDOCK scores, RMSD and Pose, the proper linear and cyclic peptides were selected and will be synthesized. A scramble peptide with similar amino acid composition with different sequence will be synthesized to examine the significance of the sequence in the future.کلیدواژه ها
Alpha synuclein, Parkinson s disease, HADDOCK, Peptide- based inhibitorsمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.