مدل سازی QSAR و داکینگ مولکولی به منظور پیش بینی فعالیت ضد سرطانی بازدارنده های PARP-1

  • سال انتشار: 1397
  • محل انتشار: شانزدهمین کنگره ملی مهندسی شیمی ایران
  • کد COI اختصاصی: NICEC16_039
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 2768
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

زینب عباسی رادمقدم

کارشناسی ارشد، گروه مهندسی شیمی، پردیس دانشکدههای فنی، دانشگاه تهران، تهران، ایران

سیاوش ریاحی

دانشیار، انستیتو مهندسی نفت، دانشکده مهندسی شیمی، گروه مهندسی شیمی، پردیس دانشکده های فنی، دانشگاه تهران، تهران، ایران

سجاد قرقانی

استادیار، گروه بیوانفورماتیک، مرکز تحقیقات بیوشیمی بیوفیزیک، دانشگاه تهران، تهران، ایران

محمد محمدی خاناپشتانی

استادیار، گروه مهندسی شیمی، دانشکده فنی فومن، دانشگاه تهران، فومن، ایران

چکیده

تکنیک محاسباتی QSAR به منظور دستیابی هر چه سریعتر و آسان تر به پارامترهای اساسی برای طراحی و تولید داروهای موردنیاز برای درمان بیماری BRCA1 روشی مقرون به صرفه و قابل اعتماد به شمار می آید. در این مطالعه، مدلسازی QSAR برای پیش بینی فعالیت ضد سرطانی به صورت غلظت مهارکنندگی نیمه (IC50) برای 51 ترکیب از مشتقات 1- اچ بنزو دی ایمیدازول- 4-کربوکسامید به عنوان بازدارنده های آنزیم PARP-1 علیه بیماری BRCA1 با استفاده از روش های GA-MLR و LS-SVM انجام گرفت. نتایج آماری ارجحیت نسبی مدل SVM به روش MLR را نشان داد به این صورت که پارامترهای آماری آن که شامل R2CV=9/049 و R2LOO=9/059 و F=130/730 و RMSE=0/132 بود، نقطه تاییدی بر قابل قبول بودن مدل انتخابی برای پیش بینی فعالیت بازدارندگی با درصد اطمینان بالا است. همچنین، داکینگ مولکولی به منظور دستیابی به انرژی آزاد اتصال و یافتن بهترین حالت اتصال لیگاند و آنزیم PARP-1 انجام شد که نتایج حاصل مکمل روش QSAR بود.

کلیدواژه ها

QSAR، داکینگ مولکولی، BRCA1، PARP-1

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.