پیش بینی ساختار پروتیین اینتگراز ویروس HTLV-1 و همترازی ساختاری ساب تایپ های ایران با سایر نقاط دنیا
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: نخستین همایش ملی یافته های نوین میکروبیولوژی
- کد COI اختصاصی: FCNFM01_106
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 416
نویسندگان
گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن، تنکابن، ایران
گروه ویروس شناسی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن، تنکابن، ایران
چکیده
شمال شرقی ایران به عنوان یک منطقه اندمیک برای ویروس HTLV-1 شناخته شده است. به ویژه در شهر های مشهد، نیشابور و سبزوار شمار افراد آلوده آمار نگران کننده ای را گزارش میدهد. اهمیت این موضوع هنگامی مشخص می شود که تاکنون هیچ پیش بینی ساختاری روی ژن اینتگراز ویروس HTLV-1 صورت نگرفته است. در این مطالعه ما تلاش می کنیم با تحلیل بیو انفورماتیکی ژن اینتگراز، راه را برای هدف قرار دادن این ژن برای طراحی دارو هموار کنیم. برای این منظور، تعداد 10 نمونه از خون بیماران HTLV-1 مثبت جمع آوری شد. برای تمام نمونه ها تست PCR و بعد از آن تعیین توالی انجام گرفت. توالی های به دست آمده از ایران و همچنین 26 توالی تام ژنوم موجود در NCBI رسم ساختار شده و مقایسه ساختاری روی آنها صورت گرفت. از برنامه های SALIGN و ESPript در پیش بینی ساختار دوم و سوم پروتیین اینتگراز استفاده شد. نتایج کار به این صورت بود که با توجه به نتایج حاصل از پیش بینی ساختار اینتگراز توسط نرم افزار های بیوانفورماتیکی ثابت شد که تمامی توالی ها در ناحیه ی اینتگراز قرابت ساختاری بسیاری دارند که نتایج حاصل در طراحی دارو پر کاربرد خواهد بود.کلیدواژه ها
HTLV-1، اینتگراز، تحلیل بیوانفورماتیکیمقالات مرتبط جدید
- Inhibitory Activity of Oliveria decumbens Essential Oil on Staphylococcus aureus Biofilm and Planktonic Cells
- Evaluation of Anti-leishmanial Effect of Selenium Nanoparticles on Leishmania major Promastigotes In Vitro
- Prevalence and Molecular Mapping of Multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in Sokoto, North-Western Nigeria
- Viral Gastroenteritis Prevalence in Iranian Pediatric Population: A Systematic Review
- Investigating the Inhibitory Effect of Probiotic Lactobacillus Species Isolated From Dairy Products
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.