Sequencing and comparative analysis of flagellin genes fliA and fliB in bovine Clostridium chauvoei isolates
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: فصلنامه طب دامی ایران، دوره: 10، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_IJVM-10-1_004
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 440
نویسندگان
Department of Anaerobic Bacterial Vaccines Research and Production, Razi vaccine and Serum ResearchInstitute, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
Department of Anaerobic Bacterial Vaccines Research and Production, Razi vaccine and Serum ResearchInstitute, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
Department of Biotechnology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research Educationand Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
چکیده
BACKGROUND: Clostridium chauvoei is the etiological agentof blackleg as an endogenous infection in cattle. Flagella havebeen known to play a critical role in the protective immunityof animals to clostridial infections. C.chauvoei has two copiesof fliC gene, namely fliA and fliB. OBJECTIVES: The aim of thisstudy was the determination and nucleotide sequence analysisof both copies of fliC genes in vaccinal strain and Iranian C.chauvoei isolates. METHODS: Six specific primers for amplificationof fliA, fliB, and flagellin (fliC) genes were designedby Oligo software. Polymerase chain reaction was performedto amplify a fragment of 700 bp for both copies of flagellin(fliA and fliB) genes. The nucleotide percentage identity anddivergence among isolates were deduced using BlAST andMegAlign softwares. RESULTS: It was found that divergencein fliB was more than fliA by sequence alignment analysis. Sixhighly conserve regions, thirty-one SNPs and 13 amino acidpolymorphisms were found in fliC gene (between fliA and fliBsequences) of Iranian C. chauvoei isolates. In comparativeanalysis, genomic similarity of the fliA and fliB genes betweenthe vaccinal strain and examined field isolates was proved to beas high as 97.3 % and 98.2%, respectively. CONCLUSIONS: ThefliC copies were identified as excellent biomarkers to study themolecular epidemiology and strain diversity among C. chauvoeiisolates. The existence of genetic variation between twoalleles of fliC gene in C. chauvoei is reported for the first timein Iran. In spite of some genetic variations, the immunologiccross protection test showed a high protection power of the localvaccine (produced by Razi Institute) against homologousand heterologous challenge.کلیدواژه ها
Clostridium chauvoei, flagellin, polymorphismمقالات مرتبط جدید
- بررسی اثر ضدباکتریایی دو محصول اسیدیفایر داخلی و خارجی بر روی برخی باکتریهای بیماریزای طیور
- تعیین غلظت عناصر معدنی پرنیاز و کم نیاز در مایع شکمبه ریز کپسوله شده با هیدروکلوئیدهای آلژینات سدیم و کیتوزان
- بررسی امکان کاربرد میکروگانیسم های پروبیوتیک در جیره غذایی به منظور افزایش راندمان تولید در کارگاه های تکثیر و پرورش ماهیان زینتی
- بررسی اثر ضدویروسی عصاره متانولی سرخارگل در کنترل ویروسVZV
- مسمومیت با ماینوکسیدیل در یک سگ
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.