مقایسه کارایی نشانگرهای رتروترانسپوزونی IRAP و REMAP مبتنی بر LTR های جو در گیاه دارویی بادرنجبویه (L.Melissa officinalis)
- سال انتشار: 1389
- محل انتشار: همایش ملی گیاهان دارویی
- کد COI اختصاصی: HERBAL01_018
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1632
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی
استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه تبریز ژئومیک و ژنتیک مولکولی ، مدیر قطب علمی اصلاح نباتات مولکولی
دانشگاه تبریز دانشکده کشاورزی گروه زراعت و اصلاح نباتات
چکیده
بادرنجبویه گیاهی از خانواده نعناعیان با کاربردهای فراوان در صنایع داروسازی است که مانند اغلب گیاهان دارویی کارهای اصلاحی کمی در آن انجام گرفته است بنابراین گام اول در اصلاح این گیاه تعیین سطح تنوع ژنتیکی و روابط اکوتیپ وحشی آن می باشد با توجه به نقش رتروترانسپوزن ها در تکامل گیاهان و نیز حفاظت شدگی توالی های تکراری طویل انتهایی (LTR) خانواده های رتروترانسپوزونی بین گونه ها و جنس های مختلف گیاهی در این پژوهش از آغازگرهای مبتنی بر LTR های رتروترانسپوزن های جو برای تولید نشانگرهای IRAPو REMAP در 12 اکوتیپ بومی و دو رقم از آلمان و ژاپن استفاده شد. در تکنیک IRAP هفت آغازگر رتروترانسپوزونی و ترکیب آنها در 115 ژنوتیپ بادرنجبویه ، 456 نشانگر با درجه چند شکلی 95% تولید کرد . ترکیب این آغازگرها با شش آغازگر ISSR در REMAP منجر به تکثیر 939 قطعه ژنومی گردید. تعداد نشانگر تولید شده به ازای هر فرد برای هر آغازگر یا ترکیب آنها در تکنیک های IRAP و REMAP به ترتیب برابر 8/89 و 9/08 بود مقایسه کارایی این دو نشانگر بر اساس میزان اطلاعات چند شکلی (PIC) و شاخص نشانگر (MI) نشان داد که نشانگرهای IRAP با متوسط PIC و MI (0/27 و 14/39) بالا در مقایسه با نشانگرهای REMAP (0/28 و 11/72) کارایی بیشتری را در تمایز و تفکیک ژنوتیپ های بارنجبویه داشتند . نتایج حاصل در مجموع نشان دهنده امکان استفاده از آغازگرهای طراحی شده بر اساس نواحی LTR رتروترانسپوزن های یک گونه در گونه ها یا جنس های دیگر بود. همچنین تکثیر تعداد زیاد قطعات ژنومی در بادرنجبویه با استفاده از هر دو تکنیک نشانگر پراکنش رتروترانسپوزون ها و جایگاه های ریزماهواره در ژنوم بادرنجبویه بود.کلیدواژه ها
بادرنجبویه، شاخص نشانگر، میزان اطلاعات چند شکلی، REMAP،IRAPمقالات مرتبط جدید
- تاثیرات درمانی زردچوبه در طب سنتی و نوین: شباهتها، تفاوت ها و چالشها
- طراحی، ساخت و ارزیابی ماشین برداشت ردیفی زیره
- بررسی فیزیولوژی - فارماکودینامیک فرآورده های گیاهی در درمان لیکن پلان دهانی
- A review on the use of artificial intelligence in the ornamental fish
- Study on the correlation Coefficients of morphological traits in Pinto Beans (Phaseolus vulgaris L.) Under salinity and drought stress
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.