معرفی و ارزیابی تکثیر نشانگرهای EST-SSR در گیاه آلوروپوس لیتورالیس
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS12_0738
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1140
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
کارشناس ارشد اصلاح نباتات، عضو هیئت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده
پیشرفت های اخیر در زمینه مطالعات ژنومی، منجر به تولید انبوهی از ترادف بیان شونده ی نشاندار EST) در بسیاری از موجودات، بویژه گونه های گیاهی شده است. در این مطالعه با داده کاوی مجموعه ترادف های EST گزارش شده در ژن بانک NCBI، برای جنس آلوروپوس (Aeluropus)، ترادف های حاوی توالی های تکراری ساده (SSR) شناسایی شدند و در مرحله بعد پس از سنتز پرایمرهای مناسب توانایی تکثیر و ایجاد چندشکلی در برخی از اکوتیپ های گونه لیتورالیس (A.littoralis) ارزیابی شد. نتایج نشان داد که از مجموع EST, 611 مورد بررسی تعداد 44 مورد حاوی نواحی ریزماهواره هستند که از این تعداد در 20 مورد طول و شرایط نواحی مجاور موتیف های SSR برای طراحی پرایمر مناسب تشخیص داده شد. همچنین نتایج بدست آمده از تکثیر جفت پرایمرها با استفاده از DNA ژنومی اکوتیپ های مختلف نشان می دهد که تمامی پرایمرهای طراحی شده توانایی تکثیر در تمام اکتیپ ها ندارند و چند شکلی مشاهده شده در لوکوس های تکثیر شده، بخوبی بر تنوع نواحی عملکردی ژنوم دلالت دارد.کلیدواژه ها
داده کاوی، ترادف بیان شونده ی نشاندار، آلوروپوس لیتورالیس، نشانگر EST-SSRمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.