بررسی گستره ژنومی خانواده ژنی CIPK در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (.Aeluropus littoralis L)
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: فصلنامه تنش های محیطی در علوم زراعی، دوره: 15، شماره: 4
- کد COI اختصاصی: JR_ESCS-15-4_011
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 199
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران
دانشیار گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
استاد گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
چکیده
شبکه سیگنالینگ CBL-CIPK یکی از مهم ترین سیستم های انتقال سیگنال در گیاهان بوده که سیگنال های کلسیم ناشی از تنش های محیطی مختلف را رمزگشایی می کند. پروتئین های متصل به یون کلسیم به عنوان مولکول های حسگر عمل نموده و با دریافت سیگنال های یون کلسیم سلولی، وظیفه هدایت پیام را به آبشارهای ژنی پایین دست بر عهده دارند. تحمل بالقوه تنش های غیرزنده خصوصا تنش شوری و قرابت آن به غلات، انگیزه اصلی بسیار از محققین برای مطالعه مکانیسم های مولکولی گونه هالوفیت Aeluropus littoralis است. در این تحقیق با توجه به در دسترس قرار گرفتن توالی ژنومی این گیاه، شناسایی این سیلیکو اعضای خانواده ژنی AlCIPK و ارزیابی پاسخ های بیانی آن ها در برابر تنش شوری مدنظر قرار گرفت. بر مبنای همولوژی با ژن های آرابیدوپسیس، ۲۰ ژن CIPK در ژنوم A. littoralis شناسایی شد. تجزیه وتحلیل جانمایی پروتئین ها نشان داد که این پروتئین ها در بخش های مختلف سلولی فعال هستند. درخت فیلوژنتیک بر مبنای توالی پروتئینی ۲۰ AlCIPK، ۲۶ AtCIPK و ۳۳ OsCIPK، نشان داد که ۷۹ CIPK موردبررسی از رابطه ارتولوژیکی قوی برخوردارند. آنالیز فیلوژنتیکی بر اساس تجزیه وتحلیل ساختار اگزون / اینترون، همه AlCIPK ها را به دو گروه کم-اینترون و غنی- اینترون تقسیم نمودند. الگوهای بیان متمایز اعضای خانواده ژنی AlCIPK انشقاق عملکردی و ساختاری این ژن ها را در طی تکامل تایید می کند. یافته های این بررسی ضمن ارائه برخی خصوصیات عملکردی خانواده ژنی سنسورهای کلسیم، اطلاعات پایه ای را برای تحقیقات آتی در مورد کارکرد بیولوژیکی این ژن ها فراهم می سازد.کلیدواژه ها
تنش شوری, شبکه سیگنالینگ پروتئین کیناز تعامل کننده با CBL, CBL-CIPK, حسگر کلسیماطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.