ارزیابی تنوع مولکولی و روابط ژنتیکی بین ارقام برنج (Oryza sativa L.)
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 7، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_CRGU-7-1_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 299
نویسندگان
دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران
استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران
استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران
استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران
چکیده
هدف از این تحقیق، ارزیابی تنوع و روابط ژنتیکی بین ۵۷ رقم برنج موجود در کلکسیون موسسه تحقیقات برنج کشور شامل ۲۶ رقم بومی ایرانی، ۱۳ رقم اصلاحشده ایرانی و ۱۸ رقم وارداتی بود کهبا استفاده از ۳۸ نشانگر ریزماهواره پیوسته با ویژگیهایکمی و کیفی روی کروموزوم ۶ برنج انجام شد. در مجموع ۲۸۱ آلل در ژنوتیپهای مورد مطالعه شناسایی شد و تعداد آللها در هر جایگاه ریزماهواره از دو تا یازده آلل متغیر بود. میانگین تعداد آللهای مشاهده شده و موثر بهترتیب ۳۹/۷ و ۱۵/۵ آلل و میانگین تنوع ژنی نئی، شاخص تنوع شانون و میزان اطلاعات چندشکلی نیز بهترتیب ۷۵۲/۰، ۶۸۵/۱ و ۷۴۱/۰ بهدست آمد که نشاندهنده وجود تنوع بالا بین ژنوتیپهای مورد مطالعه بود. برآورد شاخصهای تنوع جهت مقایسه نشانگرهای مطالعهشده نشان داد که بهترتیب نشانگرهایRM۵۱۰ ، RM۲۲۵، RM۳۱،RM۴۰۲، RM۵۲۸، RM۲۰۴، RM۱۶۲، RM۵۸۴ وRM۳ با دارا بودن بالاترین مقادیر تنوع در جمعیت مورد مطالعه، بهعنوان موثرترین نشانگرها جهت بررسی تنوع ژنتیکی در برنج بودند. ارزیابی تشابه ژنتیکی بین ارقام بومی، اصلاحشده و وارداتی برنج نشان داد که بیشترین تشابه بین ارقام بومی و اصلاحشده و کمترین تشابه بین ارقام اصلاحشده و وارداتی وجود داشت. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA بر اساس ضریب تشابه جاکارد، ۵۷ رقم مورد مطالعه را در چهار گروه جداگانه قرار داد، بهطوریکه ارقام بومی، اصلاح شده و وارداتی تا حدود زیادی از هم تفکیک شدند. بنابراین، بر اساس نتایج این تحقیق پیشنهاد میشود که ضمن استفاده از نشانگرهای RM۵۱۰، RM۲۲۵، RM۳۱،RM۴۰۲، RM۵۲۸، RM۲۰۴، RM۱۶۲، RM۵۸۴ وRM۳بهعنوان نشانگرهای کارامد و آگاهیبخش در مطالعات مربوط به تعیین تنوع ارقام برنج، از تلاقی بین ارقام موجود در گروههای دورتر حاصل از تجزیه خوشهای نیز میتوان برای تهیه ارقام جدید دارای ویژگیهای کمی و کیفی متنوع استفاده کرد.کلیدواژه ها
ارقام بومی, نشانگر ریزماهواره, ویژگی هایکمی و کیفیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.