ارزیابی تنوع مولکولی و روابط ژنتیکی بین ارقام برنج (Oryza sativa L.)

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 194

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-7-1_003

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

چکیده مقاله:

هدف از این تحقیق، ارزیابی تنوع و روابط ژنتیکی بین ۵۷ رقم برنج موجود در کلکسیون موسسه تحقیقات برنج کشور شامل ۲۶ رقم بومی ایرانی، ۱۳ رقم اصلاح­شده ایرانی و ۱۸ رقم وارداتی بود کهبا استفاده از ۳۸ نشانگر ریزماهواره پیوسته با ویژگی­هایکمی و کیفی روی کروموزوم ۶ برنج انجام شد. در مجموع ۲۸۱ آلل در ژنوتیپ­های مورد مطالعه شناسایی شد و تعداد آلل­ها در هر جایگاه ریزماهواره از دو تا یازده آلل متغیر بود. میانگین تعداد آلل­های مشاهده شده و موثر به­ترتیب ۳۹/۷ و ۱۵/۵ آلل و میانگین تنوع ژنی نئی، شاخص تنوع شانون و میزان اطلاعات چندشکلی نیز به­ترتیب ۷۵۲/۰، ۶۸۵/۱ و ۷۴۱/۰ به­دست آمد که نشان­دهنده وجود تنوع بالا بین ژنوتیپ­های مورد مطالعه بود. برآورد شاخص­های تنوع جهت مقایسه نشانگرهای مطالعه­شده نشان داد که به­ترتیب نشانگرهایRM۵۱۰ ، RM۲۲۵، RM۳۱،RM۴۰۲، RM۵۲۸، RM۲۰۴، RM۱۶۲، RM۵۸۴ وRM۳ با دارا بودن بالاترین مقادیر تنوع در جمعیت مورد مطالعه، به­عنوان موثرترین نشانگرها جهت بررسی تنوع ژنتیکی در برنج بودند. ارزیابی تشابه ژنتیکی بین ارقام بومی، اصلاح­شده و وارداتی برنج نشان داد که بیشترین تشابه بین ارقام بومی و اصلاح­شده و کمترین تشابه بین ارقام اصلاح­شده و وارداتی وجود داشت. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA بر اساس ضریب تشابه جاکارد، ۵۷ رقم مورد مطالعه را در چهار گروه جداگانه قرار داد، به­طوری­که ارقام بومی، اصلاح شده و وارداتی تا حدود زیادی از هم تفکیک شدند. بنابراین، بر اساس نتایج این تحقیق پیشنهاد می­شود که ضمن استفاده از نشانگرهای RM۵۱۰، RM۲۲۵، RM۳۱،RM۴۰۲، RM۵۲۸، RM۲۰۴، RM۱۶۲، RM۵۸۴ وRM۳به­عنوان نشانگرهای کارامد و آگاهی­بخش در مطالعات مربوط به تعیین تنوع ارقام برنج، از تلاقی بین ارقام موجود در گروه­های دورتر حاصل از تجزیه خوشه­ای نیز می­توان برای تهیه ارقام جدید دارای ویژگی­های کمی و کیفی متنوع استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

ارقام بومی ، نشانگر ریزماهواره ، ویژگی هایکمی و کیفی

نویسندگان

ادیبه نیلی

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

بابک ربیعی

استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

مهرزاد اله قلی پور

استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران

علی اکبر عبادی

استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aghazadeh, R., Ghareyazie, B., Nematzadeh, Gh. and Babaeian Jelodar, N. ...
  • Alvarez, A., Fuentes, J. L., Puldón, V., Gómez, P. J., ...
  • Allahgholipour, M., Farshadfar,E. and Rabiei,B. ۲۰۱۴. Evaluation of molecular diversity ...
  • Bao, J. S., Corke,H., He, P. and Zhu, L. H. ...
  • Bao, J., Corke, H. and Sun, M. ۲۰۰۶. Analysis of ...
  • Choudhury, B., Latif-Khan,M. and Dayanandan,S. ۲۰۱۳. Genetic structure and diversity ...
  • Collard, B. C. Y., Jahufer, M. Z. Z.,Brouwer,J. B. and ...
  • FAO. ۲۰۱۶.http://www.fao.org/fsnforum/cfs-hlpe/nutrition-and-food-systems ...
  • Grishma, S. H., Sasidharan, N.,Chakraborty, S.,Trivedi, R.,Ravikiran, R. and Davla,D. ...
  • Ivandic, V., Hackett, C.A.,Nevo, E., Keith, R., Thomas,W.T.B. and Forster,B. ...
  • Karim, K., Rawda, A.,Hatem, C.M.,Mbarek,B.N. and Mokhtar,T. ۲۰۱۰. Analysis of ...
  • Keyvankhosro, A. ۲۰۱۰. Grouping of rice cultivars based on microsatellite ...
  • Kibria, K., Nur, F.,Begum, S.N.,Islam, M.M.,Paul, S.K.,Rahman,K.S. and Azam,S.M.M. ۲۰۰۹. ...
  • Kumar, R., Kumar, A.,Kumar,S. A. and Radha,J. ۲۰۱۲. Evaluation of ...
  • Mehri-Badloo, Z. ۲۰۱۵. Identifying suitable parents for production of high ...
  • Mondini, L., Noorani, A. and Mario, A. ۲۰۰۹. Assessing plant ...
  • Murray, M. G. and Thompson,W. F. ۱۹۸۰. Rapid isolation of ...
  • Naghavi, M. R., Mardi, M.,Ramshini, H. A. and Fazelinasab,B. ۲۰۰۴. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۲. Genetic distanse between population. American Naturalist ۱۶۰: ...
  • Park, G. H., Kim, J. H. and Kim, K. M. ...
  • Pervaiz, Z. H., Rabbani, M. A.,Khaliq, I.,Pearce, S. and Malik, ...
  • Rabbani, M.A., Masood, M.S.,Shinwari,Z.K. and Shinozaki,K.Y. ۲۰۱۰. Genetic analysis of ...
  • Rabiei, B., Valizadeh, M.,Ghareyazie, B.,Moghaddam, M. and Ali, A. J. ...
  • Sajib, A.M., Musharaf Hossain, M.,Mosnaz, A.T.M.J.,Monirul Islam,M. and Shamsher Ali,M. ...
  • Sarayloo, M., Sabouri,H. and Dadras,A.R. ۲۰۱۵. Assessing genetic diversity of ...
  • Semagn, K., Bjornstad,A. and Ndjiondjop,M.N. ۲۰۰۶. An overview of molecular ...
  • Senior, M. L., Mutphy, J. P.,Goodman, M. M. and Stuber,C. ...
  • Sheng-Jun, W., Zuo-Mei L. and Jian-MinW. ۲۰۰۶.Genetic diversity among parents ...
  • Singh, S.K., Sharma, S.,Koutu, G.K.,Mishra, D.K.,Singh,P., Prakash, V.,Kumar,V. and Pal,N. ...
  • Song, L.Y., Liu, X.,Chen, W.G.,Hao, Z.F.,Bal,L. and Zhang,D.G. ۲۰۱۳.Genetic relationships ...
  • Spada, A., Mantegazza, R.,Biloni,M.,Caporali, E. andSalaF. ۲۰۰۴. Italian rice varieties: ...
  • Syahsar, B., Allahdu, M. and Shahsavand Hassani, H. ۲۰۱۰. Assessment ...
  • Tabkhkar, N., Rabiei,B. and Sabouri,A. ۲۰۱۱. Evaluating allele frequency and ...
  • Tabkhkar, N., Rabiei,B. and Sabouri,A. ۲۰۱۲. Genetic diversity of rice ...
  • Valizadeh Soumeh, Z., Samizadeh Lahiji,H. and Rabiei,B. ۲۰۱۴. Assessment of ...
  • Wang, L. Q., Liu, W. J., Xu, Y., He, Y. ...
  • Zuo, J.R. and Li,J.Y. ۲۰۱۴. Molecular dissection of complex agronomic ...
  • نمایش کامل مراجع