بررسی تنوع ژنتیکی در ارقام برنج (Oryza sativa L.) موجود در ایران با استفاده از نشانگرهای SSR
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 8، شماره: 20
- کد COI اختصاصی: JR_JCB-8-20_012
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 472
نویسندگان
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
دانشگاه گنبدکاووس
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
چکیده
به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپ های برنج موجود در ایران، تنوع موجود در ۳۸ رقم برنج با استفاده از ۱۴ نشانگر SSR بررسی شد. آزمایش در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی در مزرعه تحقیقاتی واقع در شهرستان آزادشهر در سال ۱۳۹۲ انجام شد نمونه های گیاهی در مرحله پنجه زنی در اوایل صبح از ژنوتیپ های مختلف جمعآوری شد. DNA از نمونه های گیاهی استخراج و جداسازی با استفاده ازژل پلی آکریل آمید بر روی آنها انجام شد. فواصل ژنتیکی زیاد بین ارقام تنوع بالایی را بین ژنوتیپ های برنج ایرانی نشان داد. تجزیه به مولفه های اصلی ۶۲ درصد از تغییرات را توجیه کرد. بیشترین فراوانی آللی مربوط به مکان RM۳۰۲ (۶۲/۰) و کمترین فراوانی آللی مربوط به مکان ژنی RM۲۶۲ (۲۱/۰) می باشد. میانگین فراوانی آللی ۳۹/۰ بود. بیشترین محتوای اطلاعات چند شکل در RM۲۶۲ (۸۱/۰) و کمترین در RM۲۴۱ (۳۳/۰) ثبت شد و میانگین PIC، ۵۱/۰ بود. میانگین شاخص شانون ۳۳/۰ بود از میان نشانگرهای ریزماهواره بهکار رفته در این مطالعه نشانگرهای RM۳۴۱، RM۲۵۵، RM۱۴۲ و RM۲۶۲ قدرت تمایز بالایی داشتند. بیشترین تعداد نشانگر مثبت در صفت ارتفاع دیده شد. تجزیه خوشه ای به روش وارد ژنوتیپ ها را در سه گروه قرار داد. در کل می توان گفت ارقام موجود در ایران از تنوع بالایی برخوردارند و می توان در برنامه های به نژادی از تنوع موجود در آنها بهره جست. نشانگرهای بهکار رفته در این مطالعه به دلیل رنج بالای تنوع در آنها، در مطالعات بعدی و یا کارهای اصلاحی سودمند خواهد بود.کلیدواژه ها
Genetic diversity, Rice Iranian, SSR marker, برنج ایرانی, تنوع ژنتیکی, نشانگر SSRاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.