کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری بختیاری
- سال انتشار: 1389
- محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 2، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_JOAGK-2-2_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 253
نویسندگان
دانشجوی دکتری پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
محققین ارشد بخش ژنومیکس و تولیدمثل مرکز AgResearch نیوزیلند
محققین ارشد بخش ژنومیکس و تولیدمثل مرکز AgResearch نیوزیلند
چکیده
انتخاب برای افزایش فراوانی موتاسیونهای جدیدی که فقط در برخی از زیرجمعیتها سودمند هستند باعث باقی گذاشتن نشانههایی در سطح ژنوم میشود. شناسایی این مناطق ژنومی یکی از مهمترین حوزههای تحقیقاتی در ژنتیک حیوانی است، زیرا این مناطق اغلب با QTLهای مرتبط با صفات مهم اقتصادی در ارتباط هستند. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنومی که در دو نژاد گوسفند ایرانی زل و لری-بختیاری هدف انتخابهای مختلف قرار گرفتهاند، یک کاوش ژنومیک با حدود ۰۰۰,۵۴ مارکر SNP انجام شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش FST ویر و کوکهام نشان داد که چندین منطقه ژنومی دارای شواهدی از انتخاب در این دو نژاد هستند. در این مقاله ۵ ناحیه ژنومی که در صدک ۹۹/۹۹ کل ارزشهای FST قرار گرفته بودند برای بررسیهای بیشتر انتخاب شدند. این مناطق بر روی کروموزومهای ۲، ۵، ۷ (دو ناحیه) و X واقع شدهاند. برای ارزیابی نشانههای انتخاب بر پایه روشهای عدم تعادل لینکاژی از آزمون هموزیگوسیتی هاپلوئیدی بسطداده شده استفاده شد. نتایج این آزمون به همراه بررسی دیاگرامهای شاخهبندی هاپلوتیپی در این دو نژاد وجود تفرق جمعیتی شدید در این مناطق ژنومی را تایید کرد. در نهایت بررسی QTLهای گزارش شده در مناطق اورتولوگوس گاوی نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با لاشه و تولید مثل همپوشانی دارند. این تحقیق که جزء اولین مراحل توسعه نقشه انتخاب در ژنوم گوسفند محسوب می شود میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در راستای شناسایی ژنهای متمایز کننده این دو نژاد فراهم آورد.کلیدواژه ها
: کاوش ژنومیک, تفرق جمعیتی, نشانه های انتخاباطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.