Identification of common factors involved in organ fibrosis using analysis of microarray dada
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: بیست و یکمین کنگره ملی و نهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران
- کد COI اختصاصی: BIOCONF21_0635
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 191
نویسندگان
Department of cell and molecular biology, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran
Department of Animal Sciences and Marine Biology, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran
چکیده
Fibrosis is known as a severe pathophysiological complication that can severely spoil the normal structure and function of implicated tissues. Identifying the critical genes in the occurrence of this complication in various organs can be useful in controlling and treating their fibrosis. This study aimed to identify important genes affecting fibrosis. For this purpose, three separate Microarray Datasets with access numbers GSE ۹۷۵۴۵۶ (for lung tissue), GSE۱۳۰۱۲۳ (for liver), and GSE۹۷۵۴۶ (for kidney) were downloaded from the GEO at the NCBI database, and their data was analyzed using GEO۲R. For all studies, data were analyzed utilizing the parameter P-value ≤ ۰.۰۵ and Log Fc │≥۱. The up-regulated genes of all three tissues were compared with each other, and ultimately, five common genes were identified in the fibrosis of the studied tissues (lung, liver and kidney). These five common genes were analyzed in Enrich r database .The results of the analysis of these genes showed that TAL۱, ELK۴ and NANOG were the most important upstream factors for these common genes (P-value ≤ ۰.۰۵). On the other hand, analysis of the common genes with KEGG database illustrated that they have a significant relationship with cortisol synthesis and secretion and AMPK signaling pathway (P-value ≤ ۰.۰۵). Gene ontology and biological process analysis of these genes with the Enrich r database demonstrated that these five genes are involved in different processes such as positive regulation of action potential. The findings of this study showed that common and important pathways and factors are involved in the fibrosis of studied organs. Further studies are needed to verify the results of these analyzes with further studies and samples.کلیدواژه ها
Bioinformatics, Fibrosis, Signaling pathways, Biological processes, Transcriptional factorsمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.