بررسی فراوانی پاراکوویروس انسانی نوع یک در نمونه های کلینیکی کودکان مبتلا به گاستروآنتریت با روشRT-PCR

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 151

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_MUQ-5-1_009

تاریخ نمایه سازی: 2 آبان 1401

چکیده مقاله:

زمینه و هدف: پاراکوویروس انسانی نوع یک (HPeV-۱) دارای ژنوم RNA تک رشته با قطبیت مثبت بوده و در خانواده پیکورناویروس ها قرار دارد. این ویروس عامل ایجاد گاستروآنتریت، عفونت های تنفسی و به ندرت سندرم های سیستم عصبی است. از آنجایی که تشخیص بین اسهال های پاراکوویروسی و باکتریایی از نظر ممانعت از مصرف بی رویه آنتی بیوتیک ها حایز اهمیت است. لذا این پروژه با هدف تعیین فراوانی پاراکوویروس انسانی نوع یک در نمونه های کلینیکی کودکان مبتلا به گاستروآنتریت با روش RT-PCR انجام شد. روش بررسی: RNA ویروسی از نمونه های مدفوع ۴۷۲ کودک زیر ۴ سال مبتلا به اسهال استخراج گردید. CDNAپس از تهیه با پرایمرهای اختصاصی طراحی شده از ناحیه ترجمه نشدنی (۵′UTR)، به روش RT-Nested-PCR تکثیر گردید. اندازه محصول RT-PCR پس از الکتروفورز روی ژل آگارز ۱%، ۲۶۵ جفت باز بود. برای مقایسه ۲ روش کشت سلولی و RT-PCR در تشخیص HPeV-۱، ۲۰ نمونه از نمونه های مثبت در سلول (Vero) کشت داده شد که پس از یک هفته فقط ۳ نمونه دارای CPE بودند. یافته ها: از ۴۷۲ نمونه دریافت شده در مدت ۲ سال، ۱۱۲ نمونه با تست اختصاصی RT-PCRمثبت (۷/۲۳%) بودند. نتایج این مطالعه نشان داد بالاترین فراوانی این ویروس در فصل بهار و پاییز می باشد (۰۰۱/۰p<). گروه سنی ۱۲-۶ ماه به طور معنی داری (۳۴/۰>p) بیشترین موارد مثبت را نسبت به گروه های سنی دیگر داشتند. موارد مثبت نیز در پسران به طور معنی داری (۰۰۱/۰(p< نسبت به دختران بیشتر بود. نتیجه گیری: این ارزیابی نشان داد با استفاده از روش RT-PCR اختصاصی می توان پاراکوویروس های انسانی را مستقیما از نمونه های کلینیکی با سرعت و حساسیت بالا تشخیص داد که در بررسی اپیدمیولوژی با ارزش می باشد، در ضمن مصرف بی رویه آنتی بیوتیک ها و هزینه را نیز کاهش خواهد داد.

کلیدواژه ها:

Gastroenteritis ، Epidemiology ، Parechvirus ، Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction ، ۵′ Untranslated Regions ، گاستروآنتریت ، اپیدمیولوژی ، پاراکوویروس ، واکنش زنجیره ای پلیمراز ترانس کریپتاز معکوس ، ′۵ مناطق ترجمه نشده.

نویسندگان

فریده قاضی

Tehran University of Medical Sciences

زهره عطائی

Tehran University of Medical Sciences

بهاره دبیرمنش

Tarbiat Modares University

مرتضی تقی زاده

Tehran University of Medical Sciences

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Hyypia T, Horsnell C, Maaronen M, Khan, Nalkking N, Auvineu ...
  • Oberste MS, Maher K, Pallansch MA. Complete Sequence of Echovirus ...
  • Racaniello VR. Picornaviridae: The Viruses and Their Replication. In: Knipe ...
  • Stanway G, Kalkkinen N, Roivainen M, Ghazi F, Khan M, ...
  • Ghazi F, Hughes PJ, Hyypia T, Stanway G. Molecular Analysis ...
  • Joki-Korpela P, Hyypia T. Diagnosis and Epidemiology of Echovirus ۲۲ ...
  • Legay VJ, Chomel J, Fernandez E, Lina B, Aymard M, ...
  • Stanway G, Joki-Korpela P, Hyypia T. Human Parechoviruses-Biology and Clinical ...
  • Lim KA, Benyesh-Melnick M. Typing of Viruses by Combinations of ...
  • Karsten H, Huppertz I, Drosten C. Prevalence, Types, and RNA ...
  • Benschop K, Molenkamp R, Van der Ham A, Wolthers K, ...
  • Benschop KSM, Schinkel J, Minnaar RP, Pajkrt D, Spanjerberg L, ...
  • Nix A, Kaija M, Oberste S. Detection of all Known ...
  • Baumgarte S, Luciano L, Grywna K, Panning M, Drexler J, ...
  • Harvala H, Robertson I, Mc William Leitch EC, Benschop K, ...
  • Grist NR, Bell EJ, Assaad F. Enterovirus in Human Disease. ...
  • Van der Sanden S, de Ruin E, Vennema H, Swanink ...
  • Al-Sunaidi M, Williams CH, Hughes PJ, Schnurr DP, Stanway G. ...
  • Noordhoek GT, Weel L, Poelstra E, Hooghiemstra M, Brandenburg AH. ...
  • Legay V, Chomel J, Bruno L. Specific RT-PCR Procedure for ...
  • Benschop KS, Schinkel J, Luken ME, Beld MG, Wolthers KC. ...
  • Benschop KS, William CH, Wolther KC, Stanway G, Simmonds P. ...
  • Boonyakiat, Y, Hughes PJ, Ghazi F, Stanway G. Arginine-Glycine-Aspartic Acid ...
  • Abed y, Boivin G. Human Parechovirus Types ۱, ۲ and ...
  • Tauriainen S, Martiskainen M, Oikarinen S, Lönnrot M, Hyöty H. ...
  • Tapia G, Cinek O, Witso E. Longitudinal Observation of Parechovirus ...
  • Ito M, Yamashita T, Tsuzuk H, Takeda N, Sakae K. ...
  • Drexler JF, Grywna K, Stöcker A, Almeida PS, Drosten C. ...
  • Li L, Victoria J, Alam MM, Angez M, Zaidi SZ, ...
  • Kim Pham NT, Trinh QD, Takanashi S, Abeysekera C, Abeygunawardene ...
  • Alho A, Morttila J, Ilonen J, Hyypia T. Diagnostic Potentioal ...
  • Ehrnst A, Eriksson M. Epidemiologyical Features of Type۲۲ Echovirus Infection. ...
  • نمایش کامل مراجع