ارزیابی آزمون LAMP با خصوصیت رنگ سنجی جهت ردیابی چشمی Ralstonia solanacearum در محموله های سیب زمینی ایستگاه های قرنطینه ای ایران

  • سال انتشار: 1398
  • محل انتشار: فصلنامه حفاظت گیاهان، دوره: 31، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_JPP-31-2_014
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 436
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

امه هانی نبوی چاشمی

دانش آموخته کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

ساره بقایی راوری

دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

ماهرخ فلاحتی سازگار

استاد گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

کبری مسلم خانی

مربی آموزشی گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

وحید جهانبخش مشهدی

استادیار موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی تهران ایران

چکیده

نژاد 2، بیووار 2 از کمپلکس گونه ای Ralstonia solanacearumخسارات اقتصادی قابل توجهی را به سیب زمینی در سراسر دنیا وارد می سازدو. بنابراین دستیابی به روش ردیابی حساس و اختصاصی به منظور حذف مواد گیاهی آلوده در مراکز تحقیقات وایستگاه های بازرسی قرنطینه گیاهی ضروری می باشد. در مطالعه حاضر پس از جداسازی کلنی های شبیه R. solanacearum از غده های آلوده سیب زمینی در محیط تترازولیوم کلراید، تایید مولکولی گونه با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. براساس آزمون استفاده از منابع کربنی و واکنش زنجیره ای پلیمراز اختصاصی نیزف جدایه های بدست آمده متعلق به بیووار 2 و فیلوتایپ IIمی باشند. ازمون بیماری زایی بر روی گیاهچه های سیب زمینی و گوجه فرنگی برای جدایه ها انجام و بیماری زایی جدایه ها بررسی گردید. ارزیابی غده های آلوده و یا مشکوک به آلودگی با اعمال PCR سنتی و واکنش LAMP بر روی ژن fliC با استفاده از DNA ی استخراج شده و عصاره آلوده سیب زمینی انجام گرفت. الگوی نردبانی محصو.لات LAMP و ردیابی چشمی رسوب پیروفسفات و یا تغییر رنگ ایجاد شده درنمونه های آلوده با واسط کاربردکالسیین ،دلالت بر ردیابی موفق R. solanacearum توسط واکنش LAMP دارد. اگرچه حساسیت آزمون LAMP و CFU/ml 10(4) مساوی و یا کمتر از PCR سنتی است. اما دقت واکنش مزبور جهت تایید قابل اطمینان وجود R. solanacearum در غده های سیب زمینی کافی می باشد. در مجموع، ازمون LAMP به همراه مرحله آشکارسازی کارایی چون استفاده از کالسیین، اطلاعات اولیه مناسبی را جهت غربالگری غده های آلوده قبل ازانبارداری در حین حمل ونقل استانی مهیا می سازد.

کلیدواژه ها

آلودگی پنهان، پوسیدگی قهوه ای، ردیابی چشمی، LAMP ،fliC

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.