شناسایی گروه غالب ویروس اس سیب زمینی (PVS) در ایران و بیان ژن پوشش پروتیینی آن
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: دوفصلنامه مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی، دوره: 7، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_GEB-7-2_005
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 438
نویسندگان
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، کرج، ایران
موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، کرج، ایران
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران
چکیده
بیان ژن ویروسها در باکتری برای مطالعه پروتیین ویروسها و تولید آنتی بادی اختصاصی مورد استفاده قرار میگیرد. در این پژوهش، نمونه های سیب زمینی از هشت استان ایران جمع آوری شده و ردیابی ویروس Potato virus S، به عنوان یکی از مخربترین ویروسهای سیب زمینی، بوسیله داس-الیزا و آرتی-پیسیآر انجام گرفت. تعیین گروه غالب با توجه به توالی ژن پوشش پروتیینی و پس از تجزیه فیلوژنی انجام شد. ژن کامل CP تکثیر و همسانه سازی شده و مورد توالی یابی قرار گرفت، سپس از پلاسمید pJET1.2/blunt برش داده شده و به پلاسمید بیان pET-28a (+) متصل شد و سازه (pET-28a:PVS:CP) به باکتری Escherichia coli سویه BL21 منتقل شد. بهینه سازی بیان ژن با القا بوسیله IPTG در غلظتهای 0/5، 1 و mM 2 به مدت 3، 4 و 6 ساعت انجام گرفت و توسط SDS-PAGE و وسترن بلات تایید شد. بر اساس توالی نوکلیوتیدی، جدایه های ایرانی PVS به سه گروه تقسیم شدند که یک گروه با 22 عضو به عنوان گروه غالب شناخته شد. بیان پروتیین نوترکیب با وزن 34 کیلودالتون توسط وسترن تایید شد. القاء با غلظت 1 میلیمولار IPTG و به مدت 4 ساعت بهترین بیان را نشان داد. این نخستین گزارش بیان ژن پوشش پروتیینی ویروس PVS است که برای تهیه آنتیبادی این ویروس اهمیت دارد.کلیدواژه ها
ویروس اس سیب زمینی، بیان ژن،پروتیین نوترکیب، تجزیه فیلوژنتیکی، PVSمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.