مطالعه ترانسکریپتوم چغندرقند در برهمکنش سازگار و ناسازگار با Heterodera schachtii
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: نخستین کنگره بیماری شناسی گیاهی ایران
- کد COI اختصاصی: PPC01_183
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 461
نویسندگان
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
گروه بیوتکنولوژی مولکولی، دانشکده مهندسی علوم زیستی، دانشگاه گنت، بلژیک
چکیده
نماتد سیستی چغندرقند (Heterodera schachtii, BCN) یکی از مهمترین عوامل کاهش محصول چغندرقند در بسیاری از مناطق جهان است. موثرترین و اقتصادیترین روش کنترل این نماتد استفاده از ارقام متحمل یا مقاوم است، ازاین رو مطالعه مکانیسمهای مولکولی مقاومت از اهمیت ویژهای برخوردار است. در این تحقیق، به منظور شناسایی ژنهای دخیل در حساسیت و مقاومت، ترانسکریپتوم چغندرقند و H. schachtii در برهمکنش های سازگار و ناسازگار در روزهای چهارم و دهم پس از مایهزنی نماتد با استفاده از تکنیک mRNA-seq موردمطالعه قرار گرفت. درمجموع، 16 کتابخانه cDNA ساخته و حدود 600 میلیون جفت باز (bp) داده خام حاصل شد. نتایج به دست آمده حاکی از تغییر الگوی بیان ژنهای دخیل در پاسخهای دفاعی، مسیر هورمونها، متابولیسم، تغذیه و تنظیم نسخه برداری بود. در رقم حساس، القای اغلب ژنهای مرتبط با پاسخهای دفاعی گیاه در روز چهارم و سرکوب آنها در روز دهم مشاهده شد درحالیکه در رقم مقاوم، ژنهای دخیل در پاسخهای دفاعی گیاه در هر دو زمان چهار و 10 روز پس از مایهزنی نماتد افزایش بیان نشان دادند. در برهمکنش ناسازگار، ژنهای دخیل در تشکیل جایگاه تغذیه نماتد در روز چهارم القاء شدند درحالیکه مجموعهای از ژنهای مرتبط با دفاع یا مقاومت فقط در روز دهم افزایش بیان داشتند که این امر نشان دهنده بروز واکنش مقاومت پس از نفوذ نماتد به درون ریشه و القای سینسیتیوم است. علاوه بر این، بررسی ترانسکریپتوم H. schachtii در ریشه های آلوده منجر به شناسایی تعداد زیادی از ژنهای نماتد ازجمله افکتورهای احتمالی دخیل در پارازیتیسم شد. این تحقیق، نخستین بررسی الگوی ترانسکریپتوم با استفاده از تکنیک mRNA-seq در تعامل سازگار و ناسازگار چغندرقند و BCN در دنیا است.کلیدواژه ها
مقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.