شناسایی SNP ها بین دو گونه ی Ocimum basilicum و Ocimum tenuiflorum به روش silico In
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: دومین همایش ملی گیاهان دارویی دیم ایران
- کد COI اختصاصی: HIMH02_037
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 397
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه ارومیه
دانشیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه ارومیه
دانشجوی کارشناسی ارشد گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه ارومیه
چکیده
ریحان (.Ocimum basilicum L) گیاهی یکساله متعلق به خانواده ی نعناعیان و غنی از ترکیبات فنیل پروپانوئیدی و ترپن ها می باشد که به اسانس این گیاه خاصیت دارویی بخشیده است. در این تحقیق به منظور شناسایی تنوع های تک نوکلئوتیدی (SNP ها) در نواحی کد کننده برخی ژن ها مهم دخیل در بیوسنتز فنیل پروپانوئیدها بین دوگونه O.basilicum و O. tenuiflorum از روش In Silico استفاده شد. بدین منظور ابتدا توالی نواحی کد کننده چهار ژن درگیر در این مسیر (اوژنول O- متیل ترنسفراز، سینامیل الکل دهیدروژناز، 4- کومارات کوآنزیم آ لیگاز و کافتیک اسید O- متیل ترانسفراز) در دو گونه ی O. basilicum و O. tenifoulium از سایت NCBI دانلود گردید و سپس با استفاده از نرم افزار Clastal omega هم ردیفی انجام و SNP ها شناسایی شد. نتایج هم ردیفی بین این دوگونه نشان داد که تبدیل بازهای A< -> G و T< -> C در توالی چهار ژن مورد مطالعه به فراوانی وجود دارند ولی در ژن اوژنول O- متیل ترانسفراز 113SNP یافت گردید که در مقایسه با دیگر ژن های مورد مطالعه بالاترین تنوع مشاهده شده بود. همچنین درج و حذف باز در این ژن مشاهده گردید که در سایر ژن ها وجود نداشت. به طور کلی نتایج این تحقیق نشان داد که تنوع تک نوکلئوتیدی در بین گونه های مختلف ریحان به فراوانی مشاهده می شود.کلیدواژه ها
ریحان، اوژنول O- متیل ترنسفراز، سینامیل الکل دهیدروژناز تنوع تک نوکلئوتیدیمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.