ارزیابی بیوانفورماتیکی hsa -miR-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs۷۵۲۴۵۵۶ ژن RASAL۲ و ابتلا به سرطان مثانه
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: سومین همایش ملی علوم زیستی
- کد COI اختصاصی: IAUFALABIO03_067
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 476
نویسندگان
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
چکیده
سرطان مثانه چهارمین سرطان رایج در میان مردان و سیزدهمین سرطان رایج زنان است. آنژیوژنز سرطانی یک فرایند ضروری برای پیشرفت و متاستاز سرطان مثانه است. یافته های جدید نشان می دهند که پروتئین کد شده توسط ژن RASAL۲ می تواند از آنژیوژنز در سرطان مثانه جلوگیری کند. کاهش بیان ژن RASAL۲ باعث افزایش فسفریله شدن AKT و در نتیجه افزایش بیان ژن های ETS۱ و VEGFA می شود. ژن RASAL۲ بر روی کروموزوم ۱ در جایگاه ۱q۲۵.۲ قرار دارد. پلی مورفیسم هیا تک نوکلئوتیدی از گروه مارکرهای ژنتیکی مرتبط با بسیاری از بیماری های ژنتیکی می باشند. Micro RNA ها به عنوان بیومارکر با تنظیم و کنترل بیان ژن ها در سطح Mrna اثر خود را اعمال می کنند. هدف این پژوهش ارزیابی بیوانفورماتیکی HAS-Mir-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (rs۷۵۲۴۵۵۶) ژن RASAL۲ با نقش بازدارنده ی سرطان مثانه بوده است. به این منظور پایگاه های داده ی miRWalk۲.۰ miRBase miRNASNP NCBI و DAVID مورد استفاده قرار گرفتند. بررسی ها در رابطه با rs۷۵۲۴۵۵۶ مشخص ساخت که در جایگاه این SNP آلل C به T و G تبدیل می شود، که ممکن است بر اتصال و عملکرد microRNA های مربوط به اینناحیه اثر گذار باشد. بررسی های انجام شده بر روی has-miR-۱۸۷ نشان داد که این microRNA با قدرت بالایی به ۳UTR رونوشت ژن RASAL۲ متصل می شود و عمل مهاری خود را اعمال می کند. با توجه به نقش has-miR-۱۸۷-۳p در سرطان مثانه، به دست آوردن ژن های هدف آن از طریق پایگاه داده miRWalk۲.۰ و ارزیابی مسیرهای سیگنالی مرتبط با استفاده از پایگاه داده DAVID، این microRNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردید. بر این اساس آلل C که آلل غالب در جمعیت است، در جایگاه SNP مورد نظر می تواند با بروز سرطان مثانه در ارتباط باشد.کلیدواژه ها
سرطان مثانه، RASAL۲، پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی، .has-miR-۱۸۷ rs۷۵۲۴۵۵۶مقالات مرتبط جدید
- مروری بر نقش گیاه آرتمیزیا (Artemisia annua) در درمان مالاریا از طب سنتی تا طب جدید
- مروری بر گیاهان دارویی ایران با بیشترین همپوشانی مواد موثره جهت توسعه درمانهای ترکیبی
- اسفرزه (Plantago ovata Forsk) موثر در درمان کولیک شنی در اسب
- تحلیل عوامل موثر بر کاربرد گیاهان دارویی در درمان بیماری کووید-۱۹
- تاثیر روشهای خشک کردن بر کمیت و کیفیت اسانس گیاه دارویی گزنه
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.