ارزیابی بیوانفورماتیکی hsa -miR-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs۷۵۲۴۵۵۶ ژن RASAL۲ و ابتلا به سرطان مثانه

سرطان مثانه چهارمین سرطان رایج در میان مردان و سیزدهمین سرطان رایج زنان است. آنژیوژنز سرطانی یک فرایند ضروری برای پیشرفت و متاستاز سرطان مثانه است. یافته های جدید نشان می دهند که پروتئین کد شده توسط ژن RASAL۲ می تواند از آنژیوژنز در سرطان مثانه جلوگیری کند. کاهش بیان ژن RASAL۲ باعث افزایش فسفریله شدن AKT و در نتیجه افزایش بیان ژن های ETS۱ و VEGFA می شود. ژن RASAL۲ بر روی کروموزوم ۱ در جایگاه ۱q۲۵.۲ قرار دارد. پلی مورفیسم هیا تک نوکلئوتیدی از گروه مارکرهای ژنتیکی مرتبط با بسیاری از بیماری های ژنتیکی می باشند. Micro RNA ها به عنوان بیومارکر با تنظیم و کنترل بیان ژن ها در سطح Mrna اثر خود را اعمال می کنند. هدف این پژوهش ارزیابی بیوانفورماتیکی HAS-Mir-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (rs۷۵۲۴۵۵۶) ژن RASAL۲ با نقش بازدارنده ی سرطان مثانه بوده است. به این منظور پایگاه های داده ی miRWalk۲.۰ miRBase miRNASNP NCBI و DAVID مورد استفاده قرار گرفتند. بررسی ها در رابطه با rs۷۵۲۴۵۵۶ مشخص ساخت که در جایگاه این SNP آلل C به T و G تبدیل می شود، که ممکن است بر اتصال و عملکرد microRNA های مربوط به اینناحیه اثر گذار باشد. بررسی های انجام شده بر روی has-miR-۱۸۷ نشان داد که این microRNA با قدرت بالایی به ۳UTR رونوشت ژن RASAL۲ متصل می شود و عمل مهاری خود را اعمال می کند. با توجه به نقش has-miR-۱۸۷-۳p در سرطان مثانه، به دست آوردن ژن های هدف آن از طریق پایگاه داده miRWalk۲.۰ و ارزیابی مسیرهای سیگنالی مرتبط با استفاده از پایگاه داده DAVID، این microRNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردید. بر این اساس آلل C که آلل غالب در جمعیت است، در جایگاه SNP مورد نظر می تواند با بروز سرطان مثانه در ارتباط باشد.

کلیدواژه ها:

سرطان مثانه ، RASAL۲ ، پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی ، .has-miR-۱۸۷ rs۷۵۲۴۵۵۶