ارزیابی بیوانفورماتیکی hsa -miR-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تکنوکلئوتیدی rs۷۵۲۴۵۵۶ ژن RASAL۲ و ابتلا به سرطان مثانه

  • سال انتشار: 1397
  • محل انتشار: سومین همایش ملی زیست شناسی دانشگاه پیام نور
  • کد COI اختصاصی: BCPNU03_167
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 498
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

علیرضا سلیمی دارانی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان

چکیده

سرطان مثانه چهارمین سرطان رایج در میان مردان و سیزدهمین سرطان رایج زنان است. آنژیوژنز سرطانی یک فرآیند ضروری برای پیشرفت و متاستاز سرطان مثانه است. یافته های جدید نشان میدهند که پروتئین کد شده توسط ژن RASAL۲ میتواند از آنژیوژنز در سرطان مثانه جلوگیری کند. کاهش بیان ژن RASAL۲ باعث افزایش فسفریله شدن AKT و درنتیجه افزایش بیان ژن های ETS۱ و VEGFA میشود. ژن RASAL۲ بر روی کروموزوم ۱ در جایگاه ۱q۲۵.۲ قرار دارد. پلی مورفیسمهای تک نوکلئوتیدی از گروه مارکرهای ژنتیکی مرتبط با بسیاری از بیماریهای ژنتیکی میبا شند. microRNA ها به عنوان بیومارکر با تنظیم و کنترل بیان ژنها در سطح mRNA اثر خود را اعمال میکنند. هدف این پژوهش ارزیابی بیوانفورماتیکی has-miR-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تکنوکلئوتیدی (rs۷۵۲۴۵۵۶) ژن RASAL۲ با نقش بازدارنده ی سرطان مثانه بوده است. به این منظور پایگاه های دادهی NCBI ، miRNASNP ، miRBase ، miRWalk۲.۰ و DAVID مورد استفاده قرار گرفتند. بررسیها در رابطه با rs۷۵۲۴۵۵۶ مشخص ساخت که در جایگاه این SNP آلل C به T و G تبدیل میشود، که ممکن است بر اتصال و عملکرد microRNA های مربوط به این ناحیه اثر گذار باشد. بررسیهای انجام شده بر روی has-miR-۱۸۷ نشان داد که این microRNA با قدرت بالایی به ۳ˊUTR رونوشت ژن RASAL۲ متصل میشود و عمل مهاری خود را اعمال میکند. با توجه به نقش has-miR-۱۸۷-۳p در سرطان مثانه، به د ست آوردن ژنهای هدف آن از طریق پایگاه داده miRWalk۲.۰ و ارزیابی م سیرهای سیگنالی مرتبط با استفاده از پایگاه داده DAVID ، این microRNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردید. بر این اساس آلل C که آلل غالب در جمعیت است، در جایگاه SNP مورد نظر میتواند با بروز سرطان مثانه در ارتباط باشد.

کلیدواژه ها

سرطان مثانه، RASAL۲ ، پلی مورفیسم تکنوکلئوتیدی، rs۷۵۲۴۵۵۶ ،has-miR-۱۸۷

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.