ارزیابی بیوانفورماتیکی hsa -miR-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تکنوکلئوتیدی rs۷۵۲۴۵۵۶ ژن RASAL۲ و ابتلا به سرطان مثانه

سرطان مثانه چهارمین سرطان رایج در میان مردان و سیزدهمین سرطان رایج زنان است. آنژیوژنز سرطانی یک فرآیند ضروری برای پیشرفت و متاستاز سرطان مثانه است. یافته های جدید نشان میدهند که پروتئین کد شده توسط ژن RASAL۲ میتواند از آنژیوژنز در سرطان مثانه جلوگیری کند. کاهش بیان ژن RASAL۲ باعث افزایش فسفریله شدن AKT و درنتیجه افزایش بیان ژن های ETS۱ و VEGFA میشود. ژن RASAL۲ بر روی کروموزوم ۱ در جایگاه ۱q۲۵.۲ قرار دارد. پلی مورفیسمهای تک نوکلئوتیدی از گروه مارکرهای ژنتیکی مرتبط با بسیاری از بیماریهای ژنتیکی میبا شند. microRNA ها به عنوان بیومارکر با تنظیم و کنترل بیان ژنها در سطح mRNA اثر خود را اعمال میکنند. هدف این پژوهش ارزیابی بیوانفورماتیکی has-miR-۱۸۷-۳p مرتبط با پلی مورفیسم تکنوکلئوتیدی (rs۷۵۲۴۵۵۶) ژن RASAL۲ با نقش بازدارنده ی سرطان مثانه بوده است. به این منظور پایگاه های دادهی NCBI ، miRNASNP ، miRBase ، miRWalk۲.۰ و DAVID مورد استفاده قرار گرفتند. بررسیها در رابطه با rs۷۵۲۴۵۵۶ مشخص ساخت که در جایگاه این SNP آلل C به T و G تبدیل میشود، که ممکن است بر اتصال و عملکرد microRNA های مربوط به این ناحیه اثر گذار باشد. بررسیهای انجام شده بر روی has-miR-۱۸۷ نشان داد که این microRNA با قدرت بالایی به ۳ˊUTR رونوشت ژن RASAL۲ متصل میشود و عمل مهاری خود را اعمال میکند. با توجه به نقش has-miR-۱۸۷-۳p در سرطان مثانه، به د ست آوردن ژنهای هدف آن از طریق پایگاه داده miRWalk۲.۰ و ارزیابی م سیرهای سیگنالی مرتبط با استفاده از پایگاه داده DAVID ، این microRNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردید. بر این اساس آلل C که آلل غالب در جمعیت است، در جایگاه SNP مورد نظر میتواند با بروز سرطان مثانه در ارتباط باشد.

کلیدواژه ها:

سرطان مثانه ، RASAL۲ ، پلی مورفیسم تکنوکلئوتیدی ، rs۷۵۲۴۵۵۶ ، has-miR-۱۸۷