Molecular dynamics study on the stability of peptide nanotubes placed in POPC phospholipid bilayer
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: بیستمین کنگره ملی و هشتمین کنگره بین‌المللی زیست‌شناسی ایران
- کد COI اختصاصی: BIOCONF20_328
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 332
نویسندگان
Department of Biophysics, Faculty of biological science, University of Tarbiat Modares
Department of Biophysics, Faculty of biological science, University of Tarbiat Modares
Department of Biophysics, Faculty of biological science, University of Tarbiat Modares
چکیده
The self-assembly and stacking of cyclic peptides form cyclic peptide nanotubes (CPNT). These nanotubes are able to transfer many substances such as drugs through the cell membrane. For this reason, they must maintain a stable structure in the phospholipid bilayer. Up to now the transfer of different molecules such as water, ions, glucose, glutamic acid, 5FU anticancer drug and so on through peptide nanotubes have been investigated theoretically and experimentally. In this study structure and stability of CPNT [(D-Ala-Glu-D-Ala-Gln)3] placed in POPC(1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine) bilayer, is analyzed after 40ns molecular dynamic simulation. This nanotube has been previously synthesized experimentally. This analysis indicates the role of the nonbonded interaction between the side and main chains of cyclic peptide rings and their phospholipid environment, besides the role of non-bonded electrostatic interactions between neighboring cyclic peptide rings in CPNT’s stability. In addition, the number of rings placed in the lipid bilayer along with their arrangement so that similar charges wouldn’t sit on top of each other effect CPNT’s stability. The result of this study can help further experimental investigations in this fieldکلیدواژه ها
Cyclic peptide nanotube, POPC membrane, Molecular dynamic simulationمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.