بررسی عملکرد ژن FNDC5 در گوسفند با تکنیک های بیوانفورماتیکی
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: دومین همایش ملی پژوهش های نوین در علوم دامی
- کد COI اختصاصی: NCARAS02_140
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 703
نویسندگان
دانشجوی دکتری، بخش علوم دام، دانشگاه گیلان
دانشجوی دکتری، بخش علوم دام، دانشگاه گیلان، عضو باشگاه پژوهشگران دانشگاه آزاد اسلامی واحد رشت
دانشجوی کارشناسی ارشد، بخش علوم دام،دانشگاه تهران
کارشناس مسیول امور دام سازمان جهاد کشاورزی شهرستان کمیجان
چکیده
سندرم چاقی و متابولیک به سرعت به یک نگرانی اقتصادی ، اجتماعی و سلامت جهانی تبدیل شده است که نیازمند استراتژیهای جدید درمانی است. در همین راستا ژن FNDC5 کدکننده یک پروتیین ترشحی که از عضلات حین ورزش آزاد میشود و باعث قهوه ای شدن بافت چربی سفید با تحریک بیان ژن UCP1 از طریق گیرنده های هستهای PPARA میشود، مورد مطالعه قرار گرفت. از آنجایی که این ژن در گوسفند عملکرد آن مشخص نشده است. بدین منظور از پایگاه اطلاعاتی خانواده های پروتیینی ،ProDam که براساس توالیهای مشترک1 است استفاده شد. سپس برای بررسی عملکرد پروتیین FNDC5 از وب سایت SMART ، ScanProsite ارایهدهنده Expasy و برای اثرات متقابل این پروتیین با پروتیین های دیگر از وب سایت STRING 9.1 استفاده شد. در نهایت ساختار دوم و سوم براساس توالی اسیدامینه ای در گونه گوسفند با افزارPSIPRED ، Phyre2 و I-TASSER انجام شد. نتایج حاکی از وجود دو توالی مشترک PD092082 و PD063241 بود. عضو خانواده و بالاخانواده2 فیبرونکتین نوع3 و همچنین توپولوژی3 و همولوژی4 آن مشابه ایمونوگلوبین5 میباشد. اثرات متقابل پروتیین فیبرونکتین نوع سه با C1QL4 ، VANGL2 ، UFSP2 ، YPEL1 و ZMPSTE24 نشان داد که برای ایفای نقش این پروتیین همانند آپوپتوز، تمایز، بقا و رونویسی ضروری است. همچنین نتایج ScanProsite نشان داد که دمین فیبرونکتین نوع 3 دارای یک تریپپتید (Arg-Gly-Asp)RGD میباشد، که اتصالات سلولی بواسطه اتصال تری پپتید RGDSبه integrins انجام میشود.کلیدواژه ها
ایمونوگلوبین، فیبرونکتین نوع 3، دمین- بالا خانوادهمقالات مرتبط جدید
- نقش هوش مصنوعی در توسعه پایدار منابع آب
- نشانگرهای مولکولی مشترک در شناسایی مقاومت به بیماریهای مهم گندم
- مقایسه میدانی حشره کش آبامکتین و ترکیبات معدنی در کنترل پروانه برگخوار مرکبات
- مقایسه برخی ویژگیهای خاک در باغات سیب با سنین مختلف در استان آذربایجان غربی
- تحلیل فضایی و زمانی غلظت ذرات معلق PM۲.۵ در شهر اصفهان
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.