Mechanistic Characters of Ion Permeation through Mechanosensitive Channels of Large Conductance: A Steered Molecular Dynamics Study

  • سال انتشار: 1396
  • محل انتشار: بیستمین کنفرانس شیمی فیزیک ایران (IPCC۲۰)
  • کد COI اختصاصی: ISPTC20_279
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 419
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Vahid Fadaei Naeini

School of Mechanical Engineering, College of Engineering, University of Tehran, Tehran, Iran

Majid Baniassadi

School of Mechanical Engineering, College of Engineering, University of Tehran, Tehran, Iran

Masumeh Foroutan

Department of Physical Chemistry, School of Chemistry, College of Science, University of Tehran, Tehran, Iran

چکیده

In this study, the permeation process of oppositely charged ions through mechanosensitive channels oflarge conductance is investigated using the steered molecular dynamics (SMD) simulation. The results suggest that themechanism of interaction between the ion and the key residues of the channel can vary according to the ion charge.Since some of the mentioned amino acids exist in the interior pore of the other membrane proteins, studying themechanism of interaction of these basic components with different substrates and their role in the gating process of theutmost importance. It was mentioned that Val21 sidechains interact with the ion as a selective filter in transmembranedomain.

کلیدواژه ها

Ion Permeation; Mechanosensitive Channels of Large Conductance; Molecular Dynamics Simulation

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.