آنالیز بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتوری ژن GAIدر برخی گونه های چوبی گردو وانگور، دو لپه ای سویا و آرابیدوپسیس و تک لپه ای برنج

سال انتشار: 1396
محل انتشار: پنجمین کنگره ملی زیست شناسی و علوم طبیعی ایران
کد COI اختصاصی: BSCONF05_099
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 645

دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

راحله قاسم زاده

استادیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه

پریناز جعفرپور

کارشناسی ارشد گروه علوم باغبانی، دانشگاه ارومیه

مهدی محسنی آذر

کارشناس گروه علوم باغبانی، دانشگاه ارومیه

چکیده

بخش عمده ای از تنظیم بیان ژن های گیاهی مربوط به ناحیه پروموتوری می باشد. آنالیز ناحیه پروموتوری و افزایش اطلاعات در زمینه نحوه بیان و عوامل موثر در افزایش یا کاهش بیان ژن ها برای درک مکانیسم و نحوه کار آن بسیار مفید خواهد بود. در پژوهش حاضر ناحیه پروموتوری ژن GAI در برخی گونه های چوبی (گردو و انگور)، دو لپه ای (سویا و آرابیدوپسیس) و تک لپهای (برنج) به صورت in silico مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز دادهها بیانگر وجود 6 عنصرتنظیمی پاسخ به هورمونهای متیل جاسمونات، جیبرلین، سالسیلیک اسید، آبسیزیک اسید، اکسین و اتیلن بود. اکثر موتیف های پاسخ دهنده به هورمون متیل جاسمونات CGTCA-motif) و (TGACG-motif تقریبا در همه گونه ها یکسان بود. موتیف TCA-element در انگور 4 برابرآربیدوپسیس بود در حالیکه بقیه گونه ها این موتیف را نداشتند. GARE-motif به عنوان اصلی ترین موتیف درگیر در سنتز جیبرلین فقط در گیاهان چوبی یافت شد.

کلیدواژه ها

آنالیز پروموتور، بیوانفورماتیک، موتیف، هورمون

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.