شناسایی عوامل رونویسی خانواده بزرگ AP2/ERF در گندم نان با استفاده از رویکرد بیوانفورماتیک
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: نوزدهمین کنگره ملی و هفتمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران
- کد COI اختصاصی: BIOCONF19_447
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 531
نویسندگان
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور مرکز تهران شرق
پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور مرکز تهران شرق
چکیده
گندم نان Triticum aestivum L یکی از مهمترین محصولات زراعی در مناطق قابل کشت جهان است. این گیاه منبع بسیار مهم پروتیین، یکی از مهمترین محصولات زراعی در مناطق قابل کشت جهان است. این گیاه منبع بسیار مهم پروتیین، هستند و در این میان، عوامل رونویسی AP2/ERF که یکی از مهمترین خانواده های تنظیم کنندگان رونویسی است، نقش مهمی در رشد گیاه و پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی بازی می کنند. در این پژوهش براساس مطالعات بیوانفورماتیک انجام شده، توالی های پروتیینی خانواده بزرگ عوامل رونویسی AP2/ERF از پایگاه های اطلاعاتی محتلف استخراج گردید و حضور ناحیه حفاظت شده AP2 در آنها مورد تایید قرار گرفت. خانواده AP2/ERF بر اساس نواحی اتصال به DNA اختصاصی آنها به چهار گروه طبقه بندی می گردد. توالی های پروتیینی که دارای یک ناحیه AP2 هستند در خانواده ERF اعضایی که دارای دو ناحیه AP2 هستند در خانواده Ap2 و اعضایی که دارای یک ناحیه AP2 و یک ناحیه B3 هستند در خانواده RAV قرار گرفتند. براساس نتایج بدست آمده از جستجو در پایگاه اطلاعات توالی NCBI 159 توالی پروتیینی به ترتیب 129، 25 و 5 عدد و 183 توالی پرویینی بدست آمده از پایگاه Planttfdb به ترتیب 161، 18 و 4 عدد از آنها متعلق به خانواده های AP2 ،ERF و RAV بود.کلیدواژه ها
لاتین ،Triticum aestivum، عامل رونویسی AP2/ERF، بیوانفورماتیکمقالات مرتبط جدید
- مروری بر نقش گیاه آرتمیزیا (Artemisia annua) در درمان مالاریا از طب سنتی تا طب جدید
- مروری بر گیاهان دارویی ایران با بیشترین همپوشانی مواد موثره جهت توسعه درمانهای ترکیبی
- اسفرزه (Plantago ovata Forsk) موثر در درمان کولیک شنی در اسب
- تحلیل عوامل موثر بر کاربرد گیاهان دارویی در درمان بیماری کووید-۱۹
- تاثیر روشهای خشک کردن بر کمیت و کیفیت اسانس گیاه دارویی گزنه
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.