First Characterization of Apple scar skin viroid from Apple and pear cultivars in Iran and determination of genetic diversity
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: فصلنامه حفاظت گیاهان، دوره: 28، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_JPP-28-3_020
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 304
نویسندگان
PhD Student Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Respectively
Professor Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Respectively
Professor, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science, University of Tehran, Karaj, Iran
Professor Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Respectively
چکیده
Apple scar skin viroid (ASSVd) is one of the most destructive viroid diseases in pome fruits orchards which can cause significant economic losses. Symptoms of this viroid including scaring, distortion and dappling were seen in some apple orchards in east-northern of Iran. Sampling was carried out from apple and pear orchards. The RNA was extracted by Silica capture method from leaves. ASSVd was detected by RT-PCR. The purified PCR products were cloned into pGEM®-T Easy Vector and recombinant plasmids were sequenced and sequencing analysis was done. We reported 12 new variants of ASSVd from apple and pear hosts with variable length between 329 to 334 nucleotides. Phylogenetic analysis by the neighbour joining method showed that the Iranian isolates were distinct from other isolates of ASSVd. Mutation sites were indicated along the secondary structure of ASSVd molecule. This study provides the first report of detection and molecular characterization of ASSVd in apple and pear in Iran.کلیدواژه ها
ASSVd, Secondary structure, Cloning, Phylogenetic analysisمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.