Utilizing ANFIS in rotation forest for human MicroRNA target prediction

  • سال انتشار: 1395
  • محل انتشار: سومین کنفرانس سراسری نوآوری های اخیر در مهندسی برق و کامپیوتر
  • کد COI اختصاصی: COMCONF03_342
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 478
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Elham Sadat Jafari Nasab

Department of Computer Engineering, Shahid Bahonar University, Kerman, Iran

Zahra Karami

Department of Biology,Faculty of sciences, Shahid Bahonar University, Kerman, Iran

چکیده

MicroRNAs (miRNAs) are small and non-coding ribonucleic acids that play critical roles in regulation of host genome expression at post-transcriptional level. Since finding miRNA target experimentally is costly and needs spending much time, the use of machine learning methods is a growing research area for miRNA target prediction. In this paper, a new classifier is proposed to predict human miRNA targets in which the Adaptive Neuro-Fuzzy Inference system (ANFIS) is utilized as the base classifier in rotation forest. For finding the best radii parameters of ANFIS models, Genetic Algorithm (GA) is used. Experimental results confirm that the proposed method is well comparable to the methods in the literature.

کلیدواژه ها

MicroRNA, target prediction, ANFIS, rotation forest, genetic algorithm

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.