اولین گزارش کاربرد نشانگر مولکولی TRAP و سیستم الکتروفورز ژل عمودی پلی اکریلامید بهینه و مقرون به صرفه با رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید در بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های آفتابگردان
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: اولین همایش بین المللی و چهارمین همایش ملی گیاهان داوریی و کشاورزی پایدار
- کد COI اختصاصی: MPSA04_079
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 715
نویسندگان
پژوهشگر جهاد دانشگاهی همدان
چکیده
نشانگر مولکولی جدید Target Region Amplification Polymorphism TRAP برای اولین بار در آفتاب گردان در سال 2003 کشف شد در این نشانگر از یک آغازگر ثابت طراحی شده برای توالی بیان شده برچسب دار Expressed Sequence Tag-EST و یک آغازگر تصادفی برای ایجاد نشانگر چند شکل در اطراف توالی های ژن کاندیدای هدف استفاده می شود این نشانگر بین 30-50 قطعه چند شکل ایجاد می کند و به این دلیل جزو نشانگرهای با درجه چند شکلی بالا به شمار می رود با وجود 12 سال از معرفی این نشانگر هنوز گزارشی در مورد استفاده از آن برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در آفتابگردان و حتی سایر گیاهان در کشور وجود ندارد از طرف دیگر در بسیاری از آنالیزهای مولکولی نظیر نشانگرهای مولکولی و انگشت نگاری ژنتیکی ژنوتیپ ها تعداد زیاد نمونه های آزمایشی باعث دشواری کار و صرف هزینه ساخت ژل های متعدد و همچنین صرف زمان زیاد برای انجام آزمایش می باشد در این تحقیق برای بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگر TRAP از روش جدید الکتروفورز ژل پلی اکریلامید با استفاده از رنگ امیزی اتیدییوم بروماید استفاده شده که نسبت به روش های رنگ آمیزی نقره و نشاندار کردن آغازگر ها با فلورسنت دارای مزیتهای همچون مقرون به صرفه بودن سرعت بالای آنالیز حجم بالای 196 نمونه ای در هر ازمایش و همچنین استفاده مجدد از ژل ها می باشد نتایج نشان داد که 19 ترکیب آغازگری در مجموع 116 باند ایجاد کردند که 109 تای آنها چند شکل بود محتوای اطلاعات چند شکل این نشانگر بین 0/03 و0/5 و میانگین 0/33 نشان داد که به عنوان یک نشانگر قدرتمند با چند شکلی بالا می تواند در بررسی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم آفتابگردان مورد استفاده قرار گیردکلیدواژه ها
الکتروفورز،اتیدیوم بروماید،تنوع ژنتیکی،ژل اکریلامید،TRAPمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.