کاربرد تیلینگ در ژنومیکس کارکردی
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: اولین همایش علمی پژوهشی زیست شناسی و علوم باغبانی ایران
- کد COI اختصاصی: BPCONF01_198
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 2783
نویسندگان
استادیار گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور
استادیار بخش اگرواکولوژی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی داراب
چکیده
پیشرفتهای اخیر در پروژه های توالی یابی ژنوم در مقیاس انبوه، کاربرد تکنیک های جهش سنتی را نه تنها در استراتژی ژنتیک مستقیم بلکهژنتیک معکوس امکان پذیر ساخته است. تیلینگ (هدف قرار دادن ضایعات موضعی القا شده) یک دهه پیش به عنوان جایگزینی برای جهش-های درون جایگیر(insertional mutations) ابداع گردید. مهمترین مزیت تیلینگ به عنوان یک استراتژی ژنتیک معکوس این است که می- توان آن را در هر گونه گیاهی صرف نظر از اندازه ژنوم، سطح پلوئیدی یا روش تکثیر به کار برد. همچنین راهی برای بررسی یک ژن هدف درهر گیاهی بدون داشتن دانش اولیه درباره محصول ژن میباشد که در ژنومیکس کارکردی از اهمیت بالایی برخوردار است. پروتکل تیلینگفراوانی بالایی از جهش های نقطه ای را ایجاد می کند که به طور تصادفی در ژنوم توزیع شدهاند. پتانسیل بالای جهش زایی مواد شیمیایی برایایجاد نرخ بالای جایگزینی نوکلئوتیدی به وسیله تراکم بالای جهش های گزارش شده برای جمعیت های تیلینگ در گونه های مختلف گیاهی بهاثبات رسیده است. پیشرفت های اخیر در تیلینگ مرهون ابزارهای بیوانفورماتیک، روشهای جدید شناسایی جهش از جمله اندونوکلئازهایحساس و خاص نوکلئوتیدهای جفت ناجور (mismatch) و کشف جایگزینهای متنوع برای غربالگری LI-COR و پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (Single Nocleotide Polymorphism) با استفاده از فنآوری های نسل جدید توالی یابی (Next Generation Sequencing) می باشد. استراتژی تیلینگ کاربردهای فراوانی در ژنومیکس کارکردی دارد. علاوه بر این، در مطالعات پایه و کاربردی با ایجاد تغییراتی در روشتیلینگ اصلی، روشهایی از قبیل اکوتیلینگ (Ecotilling) یا تیلینگ حذفی (Deletion Tilling) ابداع و مورد استفاده قرار گرفته است.کلیدواژه ها
تیلینگ، ژنومیکس کارکردی، جهشمقالات مرتبط جدید
- اثر وزن بنه مادری و مقادیر کود دامی بر عملکرد بنه های دختری و گل زعفران در سال دوم
- بررسی پیشرفت های ریزازدیادی زعفران ( Crocus sativus L. ) و چالشهای آن
- بررسی ارتباط غلظت آهن بنه زعفران با عملکرد ماده خشک در دو منطقه قائن و نهبندان در خراسان جنوبی
- برهمکنش شوری، کود گاوی و روش کاشت بر محصول و رشد زعفران در سال پنجم دوره رشد
- اثر محتوای فسفر برگ و بنه بر خصوصیات رشدی بنه های دختری زعفران
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.