تعیین ترادف ژنوم کامل دو جدایه ایرانی ویروس X سیب زمینی

  • سال انتشار: 1392
  • محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
  • کد COI اختصاصی: NBCI08_0856
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 795
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

شبنم پیشیار

گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه شهید باهنر کرمان

حسین معصومی

گروه گیاهپزشکی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه شهید باهنر کرمان

محمد مداحیان

جهانگیر حیدنژاد

چکیده

ویروس X سیب زمینی (PVX) یکی از ویروس های رایج سیب زمین است . به منظرو مطالعه ژنوم کامل ویروس X سیب زمینی، دو جدایه KER.ZA.1 و KER.LA.2 از مناطق بردسیر و زرند کرمان جمع آوری و آلودگی آن ها به PVX به وسیله آزمون DAS-ELISA با استفاده از آنتی سرم چند همسانه ای مورد تایید قرار گرفت . ژنوم کامل دو جدایه با استفاده از هشت جفت آغاز گر اختصاصی توسط واکنش RT-PCR تکثیر شده و بعد از قرار دادن در پلاسمید pTZ57R/T به باکتری Escherichia coli سویه JM 107 منتقل گردید . بر اساس نتایج بدست آمده طول کامل ژنوم دو جدایه معادل 6315 نوکلئوتید و خاوی زن های RdRp، TGB1،TGB2، TGB3 و CP می باشد . مقایسه ترادف های بدست آمده نشان داد که میزان مشابهت ترادف نوکلئتیدی دو جدایه 98/3 درصد می باشد . نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر تشابه بالای ترادف نوکلئتیدی ژنوم آمینواسیدی ژن های این دو جدایه با یکدیگر می باشد .

کلیدواژه ها

تعیین ترادف ژنوم کامل، ویروس X سیب زمینی، همسانه سازی

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.