شناسایی نواحی ریز ماهواره در ترادف های EST گیاه پوکسیلنیا تنیفلورا و کاربرد آن بعنوان نشانگر مولکولی
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_0627
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 735
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
کارشناس ارشد اصلاح نباتات؛ عضو هیئت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده
دراین مطالعه، ترادف های حاوی توالی های تکراری ساده(SSR) از مجموعه رکوردهای EST ثبت شده در ژن بانک در گیاه پوکسینلیا تنیفلورا (Puccinellia tenuiflora)، شناسایی واستخراج شد. سپس از مناطق مجاور ناحیه تکراری 177 جفت آغازگر رفت و برگشتی مناسب برای کاربرد بعنوان نشانگرمولکولی طراحی گردید. نتایج نشان داد که از مجموع 3815 ترادف EST مورد بررسی ، 243 رکورد واجد نواحی ریز ماهواره هستند بطوریکه موتیف های چهار نوکلئوتیدی با 63 درصد فراوانی بیشترین میزان وقوع در بانک EST گیاه، را داشتند. گیاه پوکسیلنیا تنیفلورا یک گونه شورزیست با خصوصیات علوفه ای ارزشمنداز تیره گرامینه می باشد که مقاومت بالایی به تنش های شوری و غرقابی دارد. بعنوان یک راهکارهالوفیتی، توسعه کشت این گیاه در مناطق شور و استفاده از آب های هرز به منظور تامین علوفه و حفظ محیط زیست حائز اهمیت است. آغازگرهای طراحی شده در این تحقیق می توانند در مطالعات تنوع ژنتیکی توده های بومی، سلکسیون وبهبود صفات استفاده شوندو درپروسه زراعی کردن این گیاه موثر باشند.کلیدواژه ها
داده کاوی، ترادف بیان شونده ی نشاندار، پوکسینلیا تنیفلورا،نشانگر EST-SSRمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.