بررسی مناطق با آنتی ژنسیتی بالا در ژن آلفا توکسین باکتری کلستریدیوم نویی تیپ A
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_0381
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 656
نویسندگان
بخش تحقیقات دام پزشکی و بیوتکنولوژی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی- شعبه شمال شرق هیات علمی
گروه زیست شناسی- دانشکده علوم دانشگاه فردوسی مشهد، دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی میکروبی
گروه زیست شناسی- دانشکده علوم دانشگاه فردوسی مشهد-هیات علمی
گروه زیست شناسی-دانشکده علوم دانشگاه فردوسی مشهد، دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی میکروبی
چکیده
باکتری کلستریدیوم نویی سیتوتوکسینی با نام آلفا توکسین تولید می کند که با وزن مولکولی 250 کیلو دالتون دارای فعالیت آنزیمی است و بر روی گیرنده های Rho سلول های پستانداران تاثیر می گذارد. پیش بینی نواحی اتصال به MHC در یک آنتی ژن خاص در شناسایی بیماری ها و طراحی پپتید واکسن موثر است. روش های آزمایشگاهی برای شناسایی نواحی آنتی ژنتیک سخت و زمان براست. استفاده از روش های محاسباتی برای پیش بینی مناطق آنتی ژنتیک این زمان را کاهش می دهد. در تحقیق حاضر نواحی باآنتی ژنسیتی بالا در آلفا توکسین به کمک ساختار دوم پروتئین نقشه هیدروفوبیسیته و الگو ریتم Kolaskar- tongaonkar بررسی گردید. نتایج نشان داد که بیشترین قطعات با آنتی ژنسیته بالا در نیمه دوم پروتئین (اسید آمینه 1000+) است، بنابراین نیمه دوم می تواند برای ساخت قطعات کوچک با بیشترین احتمال آنتی ژنسیتی استفاده شود.کلیدواژه ها
آلفا توکسین، کلستریدیوم نویی ، ساختار دوم پروتئین، نواحی اپی توپیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.