مقایسه روشهای PCR و شناساگرهای DNA متصل به نانو ذرات طلا برای شناسایی باکتری Pseudomonas syringae
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
- کد COI اختصاصی: NBCI07_0529
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 746
نویسندگان
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه تربیت مدرس،
۲ گروه بیماری شناسی گیاهی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه تربیت مدرس،
گروه نانوبیوتکنولوژی و گروه ژنتیک ، دانشکده علوم زیستی ، دانشگاه تربیت مدرس
گروه سم شناسی ، دانشکده پزشکی ، دانشگاه تربیت مدرس
چکیده
باکتری Pseudomonas syringae یکی از گونه های مهم در بین باکتری های بیماریزا گیاهی را شامل می شود. برای تشخیص باکتریها در مواد گیاهی، خاک، آب و یا منابع دیگر بیشتر از تکنیک های سرولوژیکی استفاده می شود. اما به دلیل محدودیتهای این روش، از جمله هزینه و وقت زیاد، روشهای مبتنی بر اسیدهای نوکلئیک پایدار، سریع و اختصاصی هستند. در این تحقیق برای شناسایی گونه P. syringae ژن Hrcv برای طراحی پرایمر و کاوشگرهای متصل به نانو ذرات طلا برای طراحی پرایمر و کاوشگرهای متصل به نانو ذرات طلا مورد استفاده قرار گرفت. تکثیر قطعه به اندازه bp440 با حساسیت شناسایی 2 نانو گرم در میکرولیتر از غلظت ژنوم در 11 پاتوار از 13 پاتوار مورد مطالعه مشاهده گردید. بعد از طراحی کاوشگرهای متصل به نانو ذرات طلا از روی توالی آن و هیبریداسیون کاوشگرها با قطعه تکثیر یافته به وسیله PCR تغییرات طول موج بین 400 تا 600 نانومتر مورد بررسی قرار گرفت و بیشترین تغییر در طول موج 520 نانومتر مشاهده گردید. همچنین تغییر رنگ از قرمز به ارغوانی مربوط به گاوشگرهای متصل به نانو ذرات طلا در 11 پاتوار از 13 پاتوار باکتریP. syringaeتکثیر یافته با PCRمشاهده گردید. به نظر می رسد روش PCR نسبت به روش گاوشگرهای متصل به نانو ذرات دارای حساسیت بیشتری ولی دارای اختصاصیت کمتری می باشد.کلیدواژه ها
PCR ، Pseudomonas syringae نانو ذرات طلا و کاوشگراطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.