تشخیص آنتاگونیست های برتر باکتری Erwinia amylovora از طریق آنالیز توالی ژن 16S rDNA
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
- کد COI اختصاصی: NBCI07_0041
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 686
نویسندگان
گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد علوم و تحقیقات دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران
موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر گیاهی شناسی
موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، بخش بیماری
چکیده
هدف از این تحقیق، جداسازی باکتریهای اپیفیت از شکوفه، برگ و شاخه درختان سالم و آلوده دانه دار و هسته دار باغهای کرج، اصفهان و نیشابور و بررسی خاصیت آنتاگونیستی آنها علیه E. Amylovora در شرایط آزمایشگاهی بود. بدین منظور، از دو آزمون آنتی بیوز و میوه نارس استفاده شد. از میان 120 جدایه باکتری جدا شده، 21 جدایه در هر دو آزمون قابلیت بازدارندگی از رشد باکتری عامل بیماری را داشتند. این جدایه ها شامل جنس های ،Serratia ،Pantoea ،Pseudomonas، Enterobacter و Bacillus بودند. از بین آنها، 4 جدایه که دارای بیشترین میزان بازدارندگی در سطح پتری و میوه نارس، رشد زیاد در سطح محیط کشت و پایداری در بازدارندگی بودند، به عنوان آنتاگونیست برتر انتخاب و از طریق آنالیز توالی ژن S rDNA 16 شناسایی شدند. بدین منظور پس از استخراج DNA، ژن rDNA 16S با استفاده از پرایمرهای P6/P0 تکثیر و باندی به اندازه 1500 جفت باز را ایجاد نمودند. قطعات حاصل به روش اتوماتیک در هر دو جهت سنس و آنتی سنس در کمپانی (Macrogen, Korea) تعیین توالی شدند. پس از همردیف کردن توالی ها با سایر توالی های مربوط به این نواحی در گونه های مختلف باکتری موجود در بانک ژن مشخص شد که با شباهت 99% جدایه E10 متعلق به گونه P. fluorescens، جدایه Abp2 به P. agglomerans، جدایه E11 به P. putida و جدایه Kgh1 متعلق به باکتری S. marcescens است.کلیدواژه ها
ءE. Amylovora، آنتاگونیست، 16S rDNAمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.