بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR)
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنگره ملی زیست شناسی و علوم طبیعی ایران
- کد COI اختصاصی: BSCONF01_509
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 869
نویسندگان
دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، دانشکده علوم پایه، بخش میکروبیولوژی، شهرکرد، ایران
موسسه تحقیقات وسرم سازی رازی، بخش توبرکولین، مالئین و یونین، کرج، ایران
موسسه تحقیقات وسرم سازی رازی، بخش واکسنهای هوازی، کرج، ایران
دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، دانشکده علوم پایه، بخش میکروبیولوژی، شهرکرد، ایران
چکیده
مشمشه یکی از مهمترین بیماریهای زئونوز بوده که توسط باکتری بورخولدریا مالئی ایجاد میگردد. یکی از روشهای مولکولی در جهت شناسایی سویه های در گردش و مولکولار اپیدمیولوژی بورخولدریا مالئی استفاده از واحدهای تکرار شونده ژنومی معروف به Tandem repeat میباشد که به دلیل مشاهده تنوع در تعداد آنها در مناطق خاصی از ژنوم سبب شناسایی تنوع در میان سویه های باکتری میگردند. در مطالعه حاضر با استفاده از روش MLVA دو لوکوس پایه به نامهای Bm1367 و Bm140 انتخاب و جهت ارزیابی تکنیک VNTR classic مجدداً طراحی پرایمر و بهینه سازی صورت پذیرفت. از سوی دیگر یک لوکوس جدید نیز به نام Bm41 با کمک نرم افزار Tandem repeat finder طراحی و به مجموعه فوق اضافه گردید. آزمون های PCR در ابتدا به صورت مستقل و سپس هر سه آزمون توسط یک پروتکل واحد فراهم گردید. بعد از توالی یابی محصول PCR شناسایی و تعیین دقیق تعداد تکرارهای ژنتیکی در هر لوکوس با استفاده از نرم افزارهای Tandem Repeat Finder و Clustal X صورت پذیرفت و تنوع ژنتیکی در بین جدایه های مورد مطالعه بررسی و در سه تیپ ژنتیکی قرار گرفت.کلیدواژه ها
بورخولدریا مالئی، BM 1367 ،BM 140 ، BM 41،VNTRمقالات مرتبط جدید
- تولید آنتی بادی پلی کلونال مونواسپسیفیک جهت شناسایی باکتریهای جنس سالمونلا
- بررسی فراوانی سویه های مدرن و اجدادی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بر اساس نشانگر TbD۱ در شمال غرب ایران
- The impact of the gut microbiome on metabolic, psychiatric, and immune diseases
- پیشگیری از سرطان خون سفری به سوی زندگی سالمتر
- Investigating the Effect of Pulegone and Neomenthol Compounds in Cancer Inhibition Using Molecular Docking
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.