CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

چندشکلی و سن تکاملی برخی خانوادههای رتروترنسپوزونی انگور با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک

عنوان مقاله: چندشکلی و سن تکاملی برخی خانوادههای رتروترنسپوزونی انگور با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک
شناسه ملی مقاله: CIGS13_1159
منتشر شده در اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:

زهرا آقاعلی - دانشجویان کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه
معصومه فرخ نیا - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه ارومیه
بابک عبدالهی مندولکانی - دانشیارگروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه ارومیه
حامد دولتی - استادیار مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان غربی

خلاصه مقاله:
به منظور بررسی چندشکلی خانوادههای رتروترنسپوزونی Huben و Gentil ،Vine1 ،Edel ،Tvv1 در انگورVitis vinifera L و تعیین قدمت و سن تکاملی آنها، نسخه مرجع هر عنصر از بانکهای اطلاعاتی ذخیره و(Long terminal repeats) LTR سمت3و5هرکدام از آنها مشخص گردید و سپس میزان تغییر و درصد چندشکلی بین دوLTR هر رتروترنسپوزون محاسبه شد. همچنین با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک، توالیهایی که مشابهت بالایی با عناصر مورد مطالعه داشتند از بانکهای اطلاعاتی شناسایی و ذخیره شدند. سپس درصد چندشکلی نواحی ' 5 و ' 3LTRهر خانواده با توالیهای مشابه محاسبه گردید. نتایج نشان داد که رتروترنسپوزونTvv1 دارای بیشترین چندشکلی در نواحی LTRبوده و قدیمیترین عنصر در بین خانوادههای مورد مطالعه میباشد. دیگر عناصر مورد مطالعه نیزچندشکلی و تنوع قابل ملاحظهای را نشان دادند. بنابراین با توجه به نتایج به دست آمده پیشنهاد میشود این خانوادهها به عنوان نشانگر ملکولی جهت مطالعه تنوع ژنتیکی و روابط تکاملی و تهیه نقشههای ژنتیکی و مکانیابی ژنها در گونههای مختلف جنسVitisمورداستفاده قرار گیرند

کلمات کلیدی:
انگورVitis vinifera L. ، بیوانفورماتیک، رتروترنسپوزونTvv1

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/328819/