چندشکلی و سن تکاملی برخی خانوادههای رتروترنسپوزونی انگور با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS13_1159
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 570
نویسندگان
دانشجویان کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه ارومیه
دانشیارگروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه ارومیه
استادیار مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان غربی
چکیده
به منظور بررسی چندشکلی خانوادههای رتروترنسپوزونی Huben و Gentil ،Vine1 ،Edel ،Tvv1 در انگورVitis vinifera L و تعیین قدمت و سن تکاملی آنها، نسخه مرجع هر عنصر از بانکهای اطلاعاتی ذخیره و(Long terminal repeats) LTR سمت3و5هرکدام از آنها مشخص گردید و سپس میزان تغییر و درصد چندشکلی بین دوLTR هر رتروترنسپوزون محاسبه شد. همچنین با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک، توالیهایی که مشابهت بالایی با عناصر مورد مطالعه داشتند از بانکهای اطلاعاتی شناسایی و ذخیره شدند. سپس درصد چندشکلی نواحی ' 5 و ' 3LTRهر خانواده با توالیهای مشابه محاسبه گردید. نتایج نشان داد که رتروترنسپوزونTvv1 دارای بیشترین چندشکلی در نواحی LTRبوده و قدیمیترین عنصر در بین خانوادههای مورد مطالعه میباشد. دیگر عناصر مورد مطالعه نیزچندشکلی و تنوع قابل ملاحظهای را نشان دادند. بنابراین با توجه به نتایج به دست آمده پیشنهاد میشود این خانوادهها به عنوان نشانگر ملکولی جهت مطالعه تنوع ژنتیکی و روابط تکاملی و تهیه نقشههای ژنتیکی و مکانیابی ژنها در گونههای مختلف جنسVitisمورداستفاده قرار گیرندکلیدواژه ها
انگورVitis vinifera L. ، بیوانفورماتیک، رتروترنسپوزونTvv1مقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.