ردیابی، تکثیر و توالی یابی بخشی از ژنHMGR در زیره سیاه کرمانی(Bunium persicum)

  • سال انتشار: 1393
  • محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: CIGS13_1151
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 979
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

داود درویشی زیدآبادی

دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس

مختار جلالی جواران

اعضای هیئت علمی گروه اصلاح نباتات، دانشگاه تربیت مدرس

حمید دهقانی

اعضای هیئت علمی گروه اصلاح نباتات، دانشگاه تربیت مدرس

سجاد رشیدی منفرد

اعضای هیئت علمی گروه اصلاح نباتات، دانشگاه تربیت مدرس

چکیده

مسیر بیوسنتز متابولیتهای ثانویه در گیاهان داروئی دارای ژنهای زیادی است. ژنHMGRاز جمله ژنهای کلیدی است که در مسیرموالونیک اسید قرار دارد و فعالیت این ژن باعث تبدیلHydroxy Methyl Glotaryl Co-Aبه موالونیک اسید میشود که اساسی ترین ترکیب در این مسیر است. ابتدا با بررسی توالیهای مشابه در سایر گیاهان از جمله گیاهان هم خانواده زیره سیاه کرمانی و همردیف کردن توالیها، نواحی حفاظت شده این ژن بررسی شد. سپس بر اساس این نواحی آغازگرهای مناسب طراحی گردید . ب ا انجامPCRو بهینه سازی دمای مناسب برای آغازگرهای طراحی شده، قطعه ژن مورد نظر تکثیر گردید. پ س از بررسی الگوی مناس ب الکتروفورزی آن و حصول اطمینان از کیفیت محصولPCRبدست آمده، قطعه تکثیر شده برای توالی یابی فرستاده شد. نتیجه توالی یابی پس از دریافت بانرم افزارهایBLAST و SeqMamمورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان دهنده تشابه بالا و همچنین هم پوشانی زیاد توالیهای موجوددر بانک ژن با قطعه ژنHMGR بدست آمده از زیره سیاه کرمانیB. persicumبود. این قطعه ژن با شماره 143741KJدر بانک ژن به ثبت رسید

کلیدواژه ها

زیره سیاه کرمانی ، Bunium persicum ، متابولیت های ثانویه ، HMGR

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.