استفاده از الگوریتمهای القای درختهای تصمیم برای جداسازی ژنوتیپهای ویروس هپاتیت سی
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS13_0855
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 932
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد فناوری اطلاعات، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه قم
دانشیار گروه زیست شناسی دانشکده علوم پایه و گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، دانشگاه قم
گروه مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه قم
فارغ التحصیل کارشناسی زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم
چکیده
هپاتیت سی یک بیماری التهابی نکروز دهنده کبد است که به صورت حاد و مزمن بروز مینماید. این ویروس دارای 6 ژنوتیپ است که 4ژنوتیپ آن گسترش جهانی داشته و ژنوتیپهای 5 و 6 در مناطق خاصی از دنیا دیده میشوند. هزینه یک دوره درمان بیماری با داروهاینسل جدید به 60 تا 80 میلیون تومان بالغ شده که پاسخ به درمان بر اساس نوع ژنوتیپ ویروس متفاوت می باشد. بنابراین تشخیص نوعژنوتیپ ابتلایی در مورد ویروس هپاتیت، قدم اول در تعیین پروسه درمانی می باشد. این مطالعه جهت تشخیص نوع ژنوتیپ براساس الگوهای تکرارشونده میباشد. روش: توالی ژنومی 742 ویروس هپاتیت سی بر اساس دو ژنوتیپ 1 و 2 تهیه شده و بانک اطلاعاتی بر اساس الگوهای 20 تاییاستخراج گردید. از 8 مدل آماری وزندهی و 3 الگوریتم تصمیم جهت تعیین متغیرهای مهم بر اساس توالیهای ژنومی 20 تایی درشناسایی ژنوتیپ 1 و 2 استفاده گردید نتیجهگیری: یافتههای مطالعه نشان داد که 4 متغیر،AAGAAAAACCAAAAGAAACA ،CAAAGAAAAACCAAAAGAAA,AAGACTGGGTCCTTTCTTGG و ATGAGCACAAATCCTAAACCمیتوانند به عنوان متغیرهای کلیدی در تشخیص نوع ژنوتیپ ابتلائی بهکار برده شوندکلیدواژه ها
ویروس هپاتیت سی، ژنوتیپ، درخت تصمیم، بیومارکر ژنومیمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.