آنالیز مولکولی توالی ژن مقاوم به زنگ قهوهای Lr10 در گونههای وحشی و زراعی گندم با سطوح پلوئیدی مختلف
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS13_0851
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 864
نویسندگان
دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
چکیده
ژن Lr10 یکی از ژنهایی است که مقاومت به زنگ قهوهای در گندم را القاء میکند. هدف این مطالعه، بررسی تنوع اللی توالی ژنLr10درگونههای وحشی و زراعی گندم میباشد. در این بررسی از 9 توالی ژنLr10در گونههای وحشی و زراعی گندم که از پایگاه اطلاعات ژنتیکیNCBIاستخراج شده بود ، استفاده گردید. ابتدا توالی ژنLr10در گونههای مختلف گندم با استفاده از نرمافزار آنلاینBLASTبا توالی این ژن در گندم نان مقایسه شد. همردیفی توالی این ژن در گونهTriticum turgidum subsp. durumبا گندم نان 100 درصدمشابهت نشان داد. نتایج همردیفی توالی نوکلئوتیدی ژنLr10در نمونههای گندم مورد بررسی با استفاده از نرمافزارCLC Sequence Viewer 6 تنوع بالایی را در سطح ژنLr10برای گونههای مورد بررسی نشان داد. همردیفی توالی آمینواسیدی ژنLr10در نمونههای مورد بررسی نیز با استفاده از نرمافزارCLC Sequence Viewer6 انجام گرفت. نتایج، حاکی از تنوع پروتئینی میان گونههای مورد بررسی میباشد. نتایج آنالیز فیلوژنتیکی توالی ژنLr10با استفاده از الگوریتمUPGMA توسط نرمافزارCLC Sequence Viewer6براساستوالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، گونهها را در 5 گروه تقسیمبندی نمود. ماتریس تشابه و فاصله توالی ژنLr10در گونههای موردبررسی، در سطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی با نرمافزارMegAlignمحاسبه گردید. در سطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، بیشترین درصد مشابهت ( 100 درصد) میان گونههای گندم نان وTriticum turgidum subsp. durum و نیز میان دو گونهTriticum dicoccoides varTriticum dicoccoides var. kotschyi و macraaronsohniiمشاهده گردید.کلیدواژه ها
آنالیز فیلوژنتیکی، ژنLr10 ، گندم، همردیفیمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.