Biodiversity of H genome containing in genus Hordeum using barley Microsatellites
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: کنگره ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی
- کد COI اختصاصی: IBRC01_072
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 840
نویسندگان
Department of Biology, University of Lorestan, Khorramabad, Iran
Department of Biology, University of Isfahan, Isfahan, Iran
Department of Biology, University of Isfahan, Isfahan, Iran
Crop Genome Research Unit, National Institute of Agrobiological Sciences (NIAS), ۲-۱-۲ Kannondai, Tsukuba, Ibaraki
چکیده
The objective of this study was to evaluate thetransferability of microsatellite markers from H. vulgareto H. bulbosum and a preliminary evaluation of theirgenetic diversity. From ninety-three pairs barley SSRprimer tested for transferability to H Genome , all of themamplified DNA segments in H. vulgare (11 accessions)and 48 pairs (51.61%) were transferable to the H.bulbosum (5 accessions) with high level of polymorphism.Twenty-two (23.65%) SSR markers showed transferabilityto H. murinum used as outgroup. A total of 546 alleleswere detected by 48 primer pairs in all accessions. Thenumber of alleles per locus ranged from 3 to 13 with anaverage of 11.375 alleles per locus. The PIC values wereranged from 0.161 to 0.621 with an average of 0.477.The value of PIC in H. vulgare (average PIC = 0.639) wassignificantly higher than H. bulbosum (average PIC =0.316). The dendrogram generated based on SSR datashowed that the accessions were divided into groupsrelated to their taxonomic classifications, indicating theefficiency of barley SSRs for phylogenetic analyses inH genome containing species in the genus Hordeum.Based on the results of this study, it can be suggested thatthe cross species transferable barley SSRs are valuablemolecular tools, for genetic diversity analyses in the H.bulbosum for which limited number of microsatellitemarkers are available. This study provided a set ofefficient SSR markers from publicly available barleymicrosatellite markers for the genetic characterization ofH. bulbosum.کلیدواژه ها
Microsatellites, genetic diversity, transferability,H genome, barleyمقالات مرتبط جدید
- نقش طب آیورودا، صابون های درمانی و روغن های گیاهی در سلامت و آرامش گردشگریسلامت و توریسم درمانی"
- اثر ارتفاع بر برخی از خصوصیات مورفولوژیکی harmala Peganum و تنوع ژنوتیپی در ۳ منطقه از استان مازندران
- تهیه و کاربرد نانوذرات نقره دوپ شده با هیدروکسیآپاتیت مشتق شده از استخوان مرغ در کاهش رنگ متیلن بلوMB
- بررسی اثر ترکیب هورمونی، شرایط نوری و نوع ریسنمونه بر کبلوسزایی گیبه دارویی گسنهUrtica dioica L
- تاثیر تنش شوری وبرخی بهبود دهنده ها بر محتوای فلاوونوئیدی و آنتوسیانینی گیاه کاملینا
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.