مقایسه توالی های بیان شده در ریشه گندم تحت تنش های شوری و خشکی
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_157
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 646
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه زنجان
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
استادیار پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
چکیده
تنشهای غیرزیستی شوری و خشکی از مهمترین عوامل تأثیرگذار بر روی رشد گندم و تولید محصول آن به شمار م یرون د. مطالعات ژنومیکس عملکردیمقاومت گندم به تنش های غیرزیستی به علت پلی پلوئیدی بودن و ژنوم بزرگ گندم با مشکلاتی همراه است. استفاده از ESTها که به طور معمول بخش-های بیان شده ژنوم میباشند میتوانند در جهت شناسایی و تشخیص ژنهایی که در مقاومت به تنشهای شوری وخشکی دخیل هستند مورد استفاده قرارگیرند. توالی های EST از دو کتابخانه cDNA مربوط به تنش شوری وخشکی از پایگاههای داده اخذ شد. بعد از تشکیل کانتیگها، شناسایی ژنها و گروهبندی عملکردی کانتیگها انجام گردید. بر اساس اجزای سلولی در هر دو تنش شوری وخشکی اجزای درون سلولی شامل غشای پلاسمایی، کلروپلاست وسیتوسول دارای بالاترین درصدها و اجزای دیگر شامل پلاستید، شبکه آندوپلاسمی و دستگاه گلژی کمترین درصدها را داشتند. بر اساس فرایندهایبیولوژیکی کانتیگها پاسخ به تنش و پاسخ به محرک های زیستی یا غیر زیستی با بالاترین درصد و فرایندهای دیگر شامل انتقال الکترون و خط سیر انرژی،انتقال پیام و متابولیسم DNA یا RNA کمترین درصدها را دارا بودند. در گروهبندی عملکردی کانتیگها بر اساس عملکردهای مولکولی فعالیت ترانسفراز،فعالیت هیدرولاز، اتصال پروتئین و اتصال DNA یا RNA با بالاترین درصدها و فعالیتهای ساختاری مولکول، فعالیت کیناز، اتصال اسید نوکلئیک و فعالیتفاکتور رونویسی کمترین درصدها را دارا میباشند.کلیدواژه ها
گندم، تنش، شوری، خشکی ،ESTمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.