مقایسه توالی های بیان شده در ریشه گندم تحت تنش های شوری و خشکی

تنشهای غیرزیستی شوری و خشکی از مهمترین عوامل تأثیرگذار بر روی رشد گندم و تولید محصول آن به شمار م یرون د. مطالعات ژنومیکس عملکردیمقاومت گندم به تنش های غیرزیستی به علت پلی پلوئیدی بودن و ژنوم بزرگ گندم با مشکلاتی همراه است. استفاده از ESTها که به طور معمول بخش-های بیان شده ژنوم میباشند میتوانند در جهت شناسایی و تشخیص ژنهایی که در مقاومت به تنشهای شوری وخشکی دخیل هستند مورد استفاده قرارگیرند. توالی های EST از دو کتابخانه cDNA مربوط به تنش شوری وخشکی از پایگاههای داده اخذ شد. بعد از تشکیل کانتیگها، شناسایی ژنها و گروهبندی عملکردی کانتیگها انجام گردید. بر اساس اجزای سلولی در هر دو تنش شوری وخشکی اجزای درون سلولی شامل غشای پلاسمایی، کلروپلاست وسیتوسول دارای بالاترین درصدها و اجزای دیگر شامل پلاستید، شبکه آندوپلاسمی و دستگاه گلژی کمترین درصدها را داشتند. بر اساس فرایندهایبیولوژیکی کانتیگها پاسخ به تنش و پاسخ به محرک های زیستی یا غیر زیستی با بالاترین درصد و فرایندهای دیگر شامل انتقال الکترون و خط سیر انرژی،انتقال پیام و متابولیسم DNA یا RNA کمترین درصدها را دارا بودند. در گروهبندی عملکردی کانتیگها بر اساس عملکردهای مولکولی فعالیت ترانسفراز،فعالیت هیدرولاز، اتصال پروتئین و اتصال DNA یا RNA با بالاترین درصدها و فعالیتهای ساختاری مولکول، فعالیت کیناز، اتصال اسید نوکلئیک و فعالیتفاکتور رونویسی کمترین درصدها را دارا میباشند.

کلیدواژه ها:

گندم ، تنش ، شوری ، خشکی ، EST